Taxonomía

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Árbol filoxenéticu, nesti casu con forma de dendrograma[nota 1], como cada nodo del dendrograma corresponder con un clado, entós ye un cladograma. Cada clado arrexunta a tolos descendientes d'una población ancestral común, ye dicir ye un grupu monofiléticu. Los nodos terminales (equí simbolizaos por lletres individuales) nun pueden dir más allá de les especies, yá que por definición, per debaxo de la categoría especie les poblaciones nun evolucionen como llinaxes independientes.
Árbol filogenético (nesti casu, les llínees representen la secuencia d'organismos ancestros y descendientes, ye un filograma[cita 1]) qu'amuesa un exemplu de diversificación d'una especie ancestral en tres especies presentes na actualidá. Cada nodo del árbol (como'l marcáu con un círculu coloráu) representa la diverxencia d'un llinaxe ancestral en dos llinaxes qu'evolucionen independientemente, esto ye, que tienen el potencial d'adquirir el so propiu set de cambeos evolutivos. En barres coloraes amuésense les apomorfías: los nuevos estaos del calter. Un cladograma puede interpretase como una secuencia d'ancestros y descendientes, lo cual ye una hipótesis que se superpone al dendrograma llográu al determinar les apomorfías de los llinaxes ancestrales. Non toos el investigadores tán d'alcuerdu n'interpretar un cladograma d'esta forma, porque por casu la hestoria filogenética del grupu puede nun dase en forma de cladogénesis.[cita 2]
Del árbol filogenético puede derivase una clasificación de los organismos. Los taxones terminales se circunscriben y arrexunten en taxones de rangu sucesivamente más altu. Los anidamientos tienen de tener congruencia o "consistencia lóxica" col árbol filogenético, anque la forma en que se tien que dar esta consistencia ta en discutiniu.[14] Nótese que la clasificación tien forma de dendrograma.

La Taxonomía (del griegu ταξις, taxis, ‘ordenamientu’, y νομος, nomos, ‘norma’ o ‘riegla’) ye, nel so sentíu más xeneral, la ciencia de la clasificación. Davezu emplégase'l términu pa designar a la Taxonomía Biolóxica, la "teoría y práctica de clasificar organismos"[15][16][cita 4] Como-y la entiende na actualidá, la clasificación biolóxica tien que ser congruente coles hipótesis de árbol filogenético disponibles, nella, los organismos arrexuntar en taxones mutuamente escluyentes de la mesma arrexuntaos en taxones de rangu más altu tamién mutuamente escluyentes, de forma que cada organismu pertenez a unu y namá un taxón en cada rangu o "categoría taxonómica". En cada taxón, los organismos tienen calteres (singular calter) que los sos estaos del calter estremar de los organismos fuera del taxón, y son los atributos qu'en xunto s'utilicen pa delimitar los taxones. La mayoría[cita 5] de los especialistes ve a les especies, a les qu'alluguen en taxones na categoría taxonómica del mesmu nome, como una realidá oxetiva, y a los distintos conceutos d'especie como distintos aproximamientos pa reconocer esos llinaxes qu'evolucionen independientemente, polo qu'a pesar de les discrepancies ente autores na so conceutu taxonómicu y polo tanto polo xeneral nos llendes taxonómiques de caúna, sueli ser considerada la categoría taxonómica más importante[cita 6][cita 7] na clasificación. Los taxones supraespecíficos son los qu'arrexunten especies y se jerarquizan en categoríes taxonómiques de rangu cada vez más altu: xéneru (grupu d'especies), familia, etc. hasta'l reinu. Nesta área tamién ta aldericáu'l conceutu de taxón a utilizar. Munchos especialistes afirmen que namá la "filosofía taxonómica" p'arrexuntar los organismos en taxones de la escuela cladista llogra que la clasificación ufierte'l serviciu que s'espera d'ella al restu de les cañes de la bioloxía, pero la escuela evolucionista tien razones pa delimitar con otros conceutos los taxones, tamién congruentes coles hipótesis d'árbol filogenético, y los dos escueles atribúyense la creación de sistemes de clasificación que cumplen en mayor midida les sos funciones de sistemes d'almacenamientu y recuperación de datos, y de predictores del estáu de los calteres y les direcciones de la evolución que nun se midieron.

La Taxonomía tamién s'ocupa d'aldericar y actualizar los Códigos Internacionales de Nomenclatura, de los que por razones históriques hai unu pa cada disciplina (Zooloxía, Botánica y Bacteries), que'l so uso pa reglamentar l'usu de nomes "formales" ta consensuáu dende fai unos 100 años. Nun Códigu define'l sistema taxonómicu a utilizar —los Códigos n'usu definen el recién descripto, conocíu como'l "sistema lineano", del que se deriva la definición de taxón equí utilizada—; decídese la formación de nomes y cuál ye'l "tipu" col que s'herieden de taxón en taxón, y se explicitan los Principios de Nomenclatura percima de les riegles, que'l so oxetivu o "principiu básicu"[19] ye aprovir la máxima estabilidá na nomenclatura. Los Códigos n'usu nun eviten les "diferencies filosófiques" ente taxónomos nos conceutos taxonómicos a utilizar nin na categoría especie nin nes categoríes supraespecíficas que son una fonte d'inestabilidá frecuente nos nomes de los taxones.

La Taxonomía Biolóxica ye equí tratada como una subdisciplina de la Bioloxía Sistemática, qu'amás tien como oxetivu la reconstrucción de la filoxenia, o hestoria evolutiva, de la vida.[cita 3] Como equí entendida la Taxonomía toma la decisión de qué sistema taxonómicu utilizar, la de qué conceutos taxonómicos acomuñar a esos taxones, la delimitación d'esos taxones dexando esplícitos los métodos que fueron utilizaos p'algamar, la formalización de los sos nomes na subdisciplina de la Nomenclatura, y tamién les ferramientes pa la Determinación o identificación de especímenes.[cita 3][cita 6] Como se calcula que namá un 10% de les especies ta descripto, como eses descripciones tienen distintos graos de resolvimientu,[cita 8] y les especies evolucionen (camuden col tiempu en términos de los sos calteres) y camuda la so distribución, la determinación funciona recursivamente cola descripción y distribución d'especies na área llamada alfa-Taxonomía o Taxonomía Descriptiva, o, deslindándola de la definición minimalista de Taxonomía que se remana dende va décades y por cuenta de que se intergradan nesa categoría taxonómica, la área de la Sistemática Descriptiva[23] o Ciencia de la Biodiversidá,[cita 6] la que s'ocupa del descubrimientu, la identificación, la descripción, la clasificación y la catalogación[cita 6] de la biodiversidá del planeta, utilizando l'organismu como unidá de trabayu y que la so prioridá[24] ye la descripción de toles especies dientro d'un contestu evolutivu.[cita 6]

La Hestoria de la Taxonomía foi largamente percorrida por éstos y otres interrogantes y a lo llargo d'ella fueron formándose'l sistema de clasificación y les riegles que nos quedaron como mandáu.

La crisis de biodiversidá que ye focu d'atención dende mediaos de 1990, la cantidá de datos acumulaos colos analís d'ADN, y la posibilidá d'intercambiar información al traviés d'internet, revitalizaron a esta ciencia nel ambiente científico dende les décades de 1990-2000, y xeneraron un alderique alrodiu de la necesidá de faer reformes sustanciales a los Códigos, dalgunes de les cualos entá se tán aldericando y otres yá s'incorporaron. Dalgunes d'estes propuestes son el BioCode, el PhyloCode, l'agregáu d'atributos al tipu nomenclatural como podríen ser los nuevos "marcadores d'ADN" (ADN barcodes), y les rellacionaes cola informatización de los datos y l'usu formal d'Internet.

Definición de taxón[editar | editar la fonte]

El taxón ye un grupu d'organismos con circunscripción, posición y rangu. De la estructura de la clasificación biolóxica como dada na introducción, comúnmente llamada "taxonomía linneana" o "sistema linneano" (pero ver[cita 9]), derívase la definición de taxón, que como explicitan los Códigos de Nomenclatura,[cita 11] ye un grupu de organismos que tien:

  • circunscripción: el conxuntu de calteres estrayíos de los organismos que lu componen que, xuntu cola riegla de decisión propuesta al observalos, diagnostiquen al taxón, establecen les sos llendes o lo delimitan, vuelven al taxón únicu, estremen los sos organismos claramente de los organismos fuera del taxón; la circunscipción definir en función de poder determinar si un organismu nuevu pertenez o non al taxón por aciu la observación de les sos calteres según el protocolu dáu, y ella puede incluyir idealmente o non una llista de calteres diagnósticos (presentes nesi taxón y namá nesi taxón), el términu aristotélicu[cita 10] "definición" sigue utilizándose nel Códigu de Zooloxía pa referise a la descripción refecha que tendría de faese d'un taxón al nomalo, de la que s'estrayería la circunscripción;[cita 12]
  • un rangu o xerarquía (absoluta)[nota 2] llamáu categoría taxonómica;
  • y una posición taxonómica formada polos taxones de rangu más altu que lo contienen.

El taxón redefinir según el "sistema" taxonómicu del que se deriva, magar la circunscripción ye necesaria p'allugar organismos nuevos nel so respectivu taxón y poro, fundamental en toles clasificaciones. Asina, pue ser modificada la so definición p'afaese a taxonomíes que nun utilicen rangos, o pueden definise los taxones de formes más acutaes, pero les filosofíes taxonómiques que formaron trés escueles de la sistemática que dexaron un legáu a la materia, estremar nel conceutu que tien d'utilizase pa tremar los organismos en taxones, ye dicir el so definición conceptual, la so delimitación conceptual, el conceutu que rellaciona los organismos del taxón más ente sí que colos demás organismos, los distintos "conceutos de taxón" o "conceutos taxonómicos".[cita 13]

La taxonomía según les distintes escueles[editar | editar la fonte]

Un clado[cita 1] nuna definición más rigorosa ye'l conxuntu d'organismos nes poblaciones actuales (en naranxa) que se hipotetiza que son toes les descendientes d'una secuencia d'ancestros y descendientes con ancestru común (en naranxa y blancu). Pero puede sese más rigorosu inda[cita 2].

Según la escuela cladista, la que predomina anguaño,[cita 15] la taxonomía ye la ciencia que tien de decidir qué clados del árbol filogenético van ser representaos por taxones y en qué categoría taxonómica allugalos.[cita 16]

Magar nos llibros de testu'l clado polo xeneral[18] defínese como "una secuencia d'una población ancestral y tolos sos descendientes", resulta ser una definición pocu rigorosa[cita 1]: el clado, como lo utilicen los taxónomos, arrexunta namá poblaciones vivientes o siquier les que s'utilizaron pa tomar los datos, les que nel métodu orixinal de Hennig –el fundador[40], o la "voz más articulada"[38] del cladismo– acomúñense como descendientes d'un mesmu llinaxe cuando se "atopen" o determinen los sos apomorfías: los cambeos de calter nel llinaxe ancestral.[cita 1] Otres formes d'analises filogenético como los métodos fenéticos (que'l so puntu de partida ye ciegu no que fai a la evolución de los calteres[cita 17][cita 18]) fueron incorporaos a la definición de clado, de forma que pueden hipotetizar un "clado" (poblaciones arrexuntaes por tener calteres compartíos dende l'ancestru común más recién) por aciu métodos d'analises non Hennigianos.[cita 1] El llector comenenciudu puede recurrir a les siguientes llectures, llistaes en Judd et al. (2007[18]): Farris (1979[53]), Donoghue y Cantino (1988[54]), Nelson y Platnick (1981[5]), Humphries y Parenti (1986[55]), Brooks y McLennan (1991[56]), Forey et al. (1992[57]), Cracraft y Donoghue (2004[58]).

"Clado" provien de cladogénesis.[cita 1] El conxuntu de tolos descendientes d'un llinaxe llámase grupu monofiléticu (monu: únicu, phylum: llinaxe) sensu Hennig,[cita 14] y los términos usualmente son utilizaos como sinónimos (pero ver[cita 2]). Los taxones que representen grupos monofiléticus llámense "taxones monofiléticus", y les apomorfías del clado que representen, que pueden habese atopáu, nun algamar de normal como circunscripción. Les apomorfías pueden habese perdíu o vueltu a derivar en dellos miembros del grupu, pueden presentar variación fenotípica en distintos ambientes nos que se presenta'l grupu que tien de ser espresada, pueden presentar los mesmos xenes pero otres variaciones por cuenta d'interacciones con otros xenes en distintos individuos o grupos que tamién tien de ser espresada, y pueden ser compartíes por otros clados que les adquirieren independientemente. Namá dempués de llograr una circunscripción (con apomorfías con tola so variación fenotípica y genotípica, y les plesiomorfías necesaries) y decidíu una categoría taxonómica, puede considerase al grupu un taxón "lineano" y decidir si nomalo según les riegles formales de nomenclatura.

La Taxonomía na actualidá. La Taxonomía (definida según la escuela cladista) decidi qué clados[cita 1] van ser los conceutos taxonómicos representaos por taxones cola so circunscripción, posición taxonómica, categoría taxonómica, y nome formal o científicu.

Hai otres escueles de clasificación. Quiciabes la más importante, dientro de les "minoritaries"[cita 15] ye la que considera que los grupos parafiléticos tamién tendríen de ser representaos por taxones nomaos formalmente, si los grupos que los conformen son lo suficientemente similares ente sigo y lo suficientemente disímiles del clado que queda fuera (escuela evolucionista[cita 19]). El autores llistaos en Judd et al. 2007[18] pal llector comenenciudu: Simpson 1961,[15] Ashlock 1979,[62] Cronquist 1987,[64] Mayr y Ashlock 1991,[16] Stuessy 1983,[65] Stevens 1986[66]. Exemplos de "taxones parafiléticos" que s'utilicen nes "clasificaciones evolucionistes" son los procariotas (parafiléticos con al respective de los eucariotes) nel clásicu sistema de clasificación en reinos empecipiáu por Whittaker (1969[67] – Margulis 1971[68]) y que güei se sigue utilizando (p.ej. Cavalier-Smith 1998[cita 20]), y les dicotiledónees, parafiléticas con al respective de les monocotiledónees (p.ej. Takhtajan 2009[69]).

Comparanza d'árboles filogenéticos (filogramas) de grupu monofiléticu, grupu parafilético y grupu polifilético. Dibuxáu a partir de Cavalier-Smith (2010[40]).
La simplificación que sufrió'l cuerpu de la planta al habese acomuñáu con hongos pal so desenvolvimientu fixo creer mientres enforma tiempu que les psilotáceas (semeya) retendríen munchos calteres ancestrales similares a los atopaos nes primeres plantes vasculares del rexistru fósil como Rhynia, anque nun s'habíen atopáu fósiles que sostuvieren esti argumentu; y hasta mediaos de los '2000 allugára-ylo como grupu hermano d'esi grupu. Les reconstrucciones filogenéticas pa les que l'enorme númberu de calteres tomaos de les llínees d'evidencia moleculares (d'ADN) fueron decisivos consensuaron qu'el so allugamientu filogenética taba añerada ente los felechus y allegaos como grupu hermano de les ofioglosáceas, lo qu'obligó a reinterpretar l'orixe evolutivu del grupu.

Otra escuela que foi encabezada por RR Sokal y PHA Sneath[70] (Sokal y Sneath 1963[47], Sneath y Sokal 1973[71], comentarios d'el autores orixinales en Sokal 1986[2] y Sneath 1995[70]) recordaba que como nun había forma de testear si yeren verdaderes les "hipótesis previes" sobre evolución, los razonamientos faíense circulares: los "grupos preferíos" determinen les "apomorfías preferíes" que de la mesma determinen los "grupos preferíos".[cita 21] Nos '60 cada autor d'una clasificación proponía un árbol dafechu distintu[cita 22] y yeren pocos los grupos que se calteníen ente autores. Sokal y Sneath non yá presentaben novedosos métodos d'analises "numbéricos"[nota 3] –cuantitativos– que sacaben provechu de les nesi momentu novedoses ordenadores, sinón que tamién yeren métodos "fenéticos"[nota 3]: intentaben nun asumir hipótesis d'evolución p'armar l'árbol, que tenía de buscase siempres qu'esistiera la posibilidá.[cita 17][cita 23] Nes últimes décades, en que "tola sistemática ye en dalguna forma numbérica"[70] por cuenta de la cantidá de calteres que se llogren de la mesma de cantidá de llínees d'evidencia distintes (a les tradicionales sumáronse los analises moleculares d'ADN, los calteres bioquímicos y de ultraestructura), pudo dase vida útil a los métodos d'esta escuela fenética que coles mesmes perdió visibilidá, porque a midida que amiéstense hipótesis evolutives p'aumentar la congruencia ente llínees d'evidencia distintes, los taxónomos van llegando a un consensu alrodiu de cuálos van ser les "verdaderes" d'elles coles qu'envalorar la filoxenia, coles qu'inferir les relaciones cladísticas.[cita 23] Dende mediaos de los '90 la sistemática vivió momentos emocionantes: empezar a acolumbrar un únicu árbol predictivu y robustu, y efectivamente, munchos grupos fueron abandonaos por nun tar basaos n'hipótesis evolutives correctes, incluyíos dalgunos de llarga data que causaron muncha sorpresa. El autores d'esta tradicionalmente llamada "escuela"[cita 19] enfatizaban que namá propunxeron métodos d'analís numbéricu[4], que fueron namá una parte d'importantes meyores numbériques n'analises filogenético, sistemática molecular, analís morfométrico ya identificación numbérica.[70]

Güei, les clasificaciones cladistas predominen por sobre les evolucionistes.[cita 15] Los dos escueles almiten que se precisen nomes tantu pa los grupos parafiléticos como pa los monofiléticus que los tomen, el discutiniu ente cladistas y evolucionistes anicia en cuál ye'l sistema de nomes que tendría de formalizase nuna clasificación.[cita 24] Los evolucionistes formalicen nomes de grupos parafiléticos, y menten con nomes informales los grupos monofiléticus non clasificaos (por casu Cavalier-Smith 1998 d'equí p'arriba[cita 20] formaliza los reinos y noma los supergrupos d'eucariotes ensin formalizalos), ente que los cladistas formalicen namá grupos monofiléticus, llamando con nomes informales los grupos parafiléticos (por casu Adl et al. 2005[90] formalicen los supergrupos d'eucariotes y proponen el nome informal procariotas o bacteries pa esi grupu parafilético).

Los dos funciones de los sistemes de clasificación[editar | editar la fonte]

Más allá de les resultancies de los analises filogenéticos, toles escueles coinciden en que la formalización de taxones en sistemes de clasificación tien dos funciones, en mires de ser un serviciu pa tou un abanicu d'usuarios finales, que non siempres pueden faese coincidir:

  • Tienen De dexar faer identificaciones,[18][cita 25] o vistu d'otra manera, tienen de funcionar como un sistema de almacenamientu y recuperación de datos; pa lo que cada taxón ten de tar claramente delimitado: un espécime atopáu del que pudieren estrayese los estaos de los sos calteres, tendría de poder allugase inequívocamente nun taxón conocíu. Los científicos en toles disciplines tienen d'utilizar los taxones como unidá de trabayu, y publicar les resultancies de los sos trabayos en relación al taxón estudiáu. Polo tanto los nomes científicos de los organismos, los taxones formales, tienen de representar el consensu de la comunidá científica, namá d'esta forma funcionen como llave d'accesu a un cuerpu d'información que refier siempres al mesmu grupu d'organismos, anque tea esvalixáu en llibros y revistes escritos en munches llingües por distintos autores, o venga de distintos campos de la bioloxía o la divulgación: como idealmente faen referencia los taxónomos, "El nome d'un organismu ye la llave escontra la so lliteratura"[cita 26]
  • Tienen De dexar faer predicciones.[18][cita 25]; o faer pronósticus (que nun tán amestaos a un métodu sinón a un autor, nesti casu l'autor de la clasificación y quiciabes tamién l'autor final) y dar esplicaciones. Por casu, cuando s'atopa un compuestu d'interés médicu nuna planta, ye común qu'haya interés n'investigar si esi compuestu atópase tamién n'otres especies rellacionaes con ella; una taxonomía bien armada tendría de dexa-y al investigador presuponer a priori les llendes de la so investigación pa los que sía más probable confirmar les sos hipótesis y aforrar esfuerzos de muestreo.[18]

La decisión de si armar la clasificación pa predicir o pa identificar percorrió tola hestoria de la taxonomía; los dos funciones coincidiríen nuna clasificación que fuera coles mesmes "natural" como "artificial",[cita 27] ye dicir que los sos conceutos taxonómicos sían "naturales" y que los sos taxones sían "artificiales" -como siempres lo son, nes definiciones equí remanaes-, con claves d'identificación que la reensamblen en grupos con paecencies superficiales y polo tanto bien pocu predictivos, pero con riegles de decisión esplícites coles que se llegue con facilidá al taxón terminal.[cita 25] La dificultá anicia en que si se fai l'exerciciu de buscar un solu calter que sía diagnósticu d'un taxón (si l'organismu tien un estáu del calter, pertenez al taxón, si tien otru estáu, nun pertenez al taxón, invariablemente, ye dicir una clasificación monotética), va notase qu'esta busca puede fallar siquier potencialmente en tolos grupos "naturales", por cuenta de que toos los calteres son inestables en dalgún grau y pueden evolucionar, y esto puede asoceder tamién si toma un conxuntu de calteres. La forma alternativa de circunscripción ye proponer los estaos de forma probabilística, esto ye, un organismu ye miembru d'un taxón si tien un númberu bien alto d'estaos de calteres similares a la descripción del taxón, especialmente de los pocu lábiles.[cita 28] El mesmu algoritmu politético va dar siempres la mesma resultancia, basáu nes probabilidaes, pero dacuando puede nun ser l'esperáu. Equí atópase la diferencia fundamental ente lo qu'el autores llamen clasificaciones "naturales" y "artificiales": na clasificación natural, la determinación ye una probabilidá de tar acertáu, dicho otra manera un porcentaxe de vegaes espérase que la determinación llegue a un taxón correctu pero con un conceutu taxonómicu distintu del esperáu. Esto ye porque'l grupu (el conceutu taxonómicu) esiste independientemente de si'l taxónomo lo circunscribió correchamente, y independientemente de la clave d'identificación utilizada. Nes clasificaciones artificiales, con tanto taxones como conceutos taxonómicos artificiales, la determinación, anque provenga d'un pesaje probabilístico de los calteres, siempres ye la correcta, anque'l grupu nun resulte ser lo qu'el taxónomo tenía en mente. El trabayu del taxónomo manifestar na so habilidá pa correxir los grupos artificiales creaos pol home (los taxones) de forma d'averalos cada vez más a los grupos naturales (los conceutos "naturales") con cada agregáu d'información nueva.[nota 4]

Si un grupu "natural" ye un grupu "predictivu" y esto, en taxones cimeros a especie, llograr el númberu y pesu de los calteres, midíos y non midíos, compartíos polos miembros del grupu qu'evolucionen xuntos, entós la "naturalidá" de los grupos va ser una cuestión de grau, y va haber grupos más o menos similares, o más o menos "naturales".[cita 27] El so componente más importante ye l'hestóricu o filogenético,[2] qu'amás ufierta impreses nes sos semeyances fenéticas les restricciones construccionales qu'acuten les direcciones de la evolución del grupu d'una forma que nun puede ser esplicada por factores ecolóxicos.[40] Tanto cladistas como evolucionistes axudíquense les clasificaciones con mayor valor predictivu, o "más naturales" (p.ej. T Cavalier-Smith[cita 29], Y Mayr[cita 30], NIN Platnick[cita 31], Hörandl y Stuessy[cita 32]).

Construyendo una clasificación[editar | editar la fonte]

Anguaño los taxónomos, entá dientro de la escuela cladista (p. ex. Judd et al. 2007[18]:33), tienen claro que nun ye d'utilidá que cada clado o conceutu de taxón penriba de especie formalícese, ye dicir corresponder con un "taxón nomáu" acorde a les riegles consensuaes nos Códigos Internacionales de Nomenclatura. Les decisiones a la de sintetizar l'árbol, inevitables, pueden paecer un pocu arbitraries por falta de métodos confiables pa llograr los dos oxetivos acabante mentar[cita 33], pero pueden xeneralizase dellos criterios ([18]:32-35):

Ficheru:Reconstrucciones filogenéticas y árbol consensu.svg
Un taxón ye congruente con toles llínees d'evidencia cuando ye posible derivalo de toes elles. Nel exemplu diagramado, nel que los árboles son interpretaos como filogramas hennigianos (ensin marcar les apomorfías en cada caña), tolos taxones parafiléticos posibles derivaos de los dos árboles tamién pudieren derivase del árbol consensuáu, exemplos más complexos nos qu'esto nun ye posible entren en xuegu cuando se tienen en cuenta les apomorfías.
  1. El criteriu principal ye la fuerza de la evidencia que sofita al grupu[18]: pa convertir un grupu en taxón formal tien d'haber un analís filogenético que lo sofite de forma robusta, sobre la base de más d'una llínea d'evidencia de forma que toes elles amuesen congruencia[nota 5]. Según Judd et al.[18] esto s'evidencia nuna cantidá importante de apomorfías que definan el so ancestru.
  2. Tien De haber una cantidá de calteres diagnósticos que dexen estremalo claramente del restu de los taxones.[18] Según dellos sistemáticos cada taxón tendría de poder ser diagnosticáu morfológicamente no posible (p.ej.[18],[104]).
  3. Tendríen De poder inferise aspeutos de la so bioloxía únicos a esi taxón, pa ello tendría de tener calteres morfolóxicos interesantes ("obvios") que dexen qu'el taxón pórtese como una unidá predictiva (Judd et al. 2007[18]:33).
  4. Dellos autores[18] afirmen que los taxones tendríen de tener, no posible, ente trés y siete subtaxones, un númberu que puede remanar con facilidá la memoria humana.[105] Nes palabres de Davis y Heywood (1963[91]:83 citáu en Judd et al. 2007[18]): "Tenemos De ser capaces d'allugar a los taxones en taxones de categoría más alta de forma que podamos atopalos de nuevu". Los sistemes de clasificación dexen la creación de categoríes entemedies hasta llograr el númberu de taxones deseyaos en caúna.
  5. Por estabilidá de la nomenclatura, los taxones que yá fueron nomaos nel pasáu tienen de siguir col mesmu nome no posible, nun siendo qu'haya fuertes xustificaciones p'abandonalos.

Hai dos criterios pa decidir la categoría taxonómica. Unu, el tradicional, ye'l qu'esiste dende los entamos de la clasificación y ye anterior a la teoría de la evolución; ésti decide la categoría taxonómica según el grau de variación del plan corporal ente taxones.[40] Dende la incorporación de la teoría de la evolución al pensamientu científicu, interpretar a la categoría taxonómica como la que deriva d'un grupu de apomorfías qu'apurren ciertu grau de variación nel plan corporal del taxón en relación a los demás taxones na mesma categoría.[40] Entós los reinos y los filos (les categoríes más altes) deriven de tresformamientos evolutivos importantes que definieron de nuevu'l plan corporal, a les que siguió un batallón de novedaes evolutives forzaes a afaese al nuevu cambéu, ente que les categoríes más baxes, como xéneros y especies, tienen variaciones en calteres más triviales, y polo tanto más inestables.[40] Esta construcción de categoríes, basada en variación de calteres más a menos estables, ye la que llegó hasta los nuesos díes y probó ser útil pa los usuarios finales d'una clasificación (ej. Cavalier-Smith 2010[40]). Otru criteriu de clasificación en categoríes foi l'empecipiáu por Hennig (1950,[36] 1966[37]), quien proponía que la edá xeolóxica absoluta d'un grupu fuera'l criteriu pa decidir la so categoría taxonómica, y magar hai científicos trabayando pa llograr esta meta en dellos grupos[106] según otros paez ser un conceutu abandonáu[nota 6]. Les categoríes resultaron ser útiles pa los oxetivos de la clasificación (ej.[108][109],[110]), pero dalgunos autores tornar por considerales arbitraries[nota 7] y hasta los hai que proponen esaniciar el sistema de clasificación con categoríes (por casu en de Queiroz 2006[nota 8]). Por razones históriques utilícense les categoríes linneanas de clasificación: reinu, filu o división, clase, orde, familia, xéneru y especie.

La clasificación na categoría especie[editar | editar la fonte]

Filograma de tipu "spindle" de los vertebraos (cada fusu d'esti exemplu arrexunta families emparentaes). Los llinaxes caracterizar por ser "cohesivos" en cada momentu y "continuos" nel tiempu, el so pool xenéticu ta integráu pero camuda a lo llargo del tiempu, polo que non necesariamente representen semeyanza fenotípica nin genotípica (Simpson 1961,[15] Mayr 1963,[113] Ghiselin 1974,[114] Hull 1976,[115] 1978,[116] Wiley 1978,[117] Hennig 1966,[37] 1975,[118] Platnick 1977[119]:97, como citaos en Hull 1979[3]).

Un "conceutu de taxón" particular ye'l de especie. La mayoría de los especialistes ve les especies, a les qu'alluguen en taxones nel rangu o categoría taxonómica del mesmu nome, como un "taxón natural", una realidá oxetiva,[cita 5] faciendo usu los distintos conceutos d'especie de los distintos aproximamientos o les distintes propiedaes emerxentes nel nivel d'organización del llinaxe qu'evoluciona independientemente, esto ye que, siquier potencialmente, adquier el so propiu set de cambeos evolutivos. A diferencia de la situación nos rangos más altos, el fechu de qu'esti rangu ye oxetivu y qu'esiste siquier ente o en forma de dos cotes cimera ya inferior ye pocu cuestionáu na práctica, ye-y intuitivu al legu,[120] y ye el conceutu que fai que cobren sentíu oxetivos d'otres cañes como "caltener toles especies": un llinaxe que se pierde nun puede ser refechu ensin cambeos evolutivos en llinaxes emparentaos. Pero como nun se sabe cómo van evolucionar los llinaxes y polo tanto cuálos de les delimitaciones posibles constitúin una "unidá evolutiva" en procesu de especiación, o cuál considerar la "unidá evolutiva especie" cuando distintos calteres evolucionen d'a grupos de tamaños distintos, la delimitación dacuando vuélvese dafechu una cuestión de consensu.

Les gaviluetes del xéneru Larus presenten alredor del Árticu un aníu de poblaciones que los sos estremos nun son interfértiles. Los taxónomos reconocen ente 2 y 8 especies. Sobre la base d'esti gráficu nel primer conceutu taxonómicu de la taxonomía moderna Lineo nomara 7 "tipos" en correspondencia colos 7 nomes vulgares, y reconociera la esistencia d'híbridos ente ellos, dexando a resolver el problema de les llendes de cada especie.

Un llinaxe, una especie, consta d'una o un grupu de poblaciones, que tamién son difíciles de definir, magar el conceutu espacial, les sos llendes xeográfiques, metodológicamente siempres tán presentes. De normal defínense como un grupu de individuus d'una mesma especie qu'ocupen una rexón xeográfica más o menos bien definida y colos individuos interactuando ente sigo.[18] Estes "interacciones" non yá refieren al intercambiu de xenes que puede habelo o non según el so tipu de reproducción sinón tamién al fechu de que compiten polos mesmos recursos, comparten les mesmes condiciones, son afectaos polos mesmos gremios de predadores, patóxenos y parásitos y de competidores interespecíficos por dalgún recursu, tienen les mesmes interacciones de simbiosis y comensalismo con otres especies, y reprodúcense y esvalixen polos mesmos mecanismos, polo que la población sufre amás de los avatares del azar una selección de xenes por aciu la supervivencia y reproducción sexual o asexual d'aquellos individuos que los porten y que la so descendencia eventualmente ocupa'l nichu qu'ocupaben los demás.[121] (El nichu n'ecoloxía definir en función de la supervivencia del llinaxe[122]: les característiques ecolóxiques del xéneru o rangos cimeros nun algamar pa esplicar cómo sobreviven los sos llinaxes; dellos taxónomos pueden utilizar una definición más amplia de nichu pa referise a los espacios dimensionales qu'acuten el nichu de les especies arreyaes en taxones cimeres, conceutu qu'otros prefieren llamar "zones adaptatives".[nota 9]) Estes interacciones ente individuos que caltienen integráu'l llinaxe son definíes tradicionalmente como "cohesión",[cita 34] un conceutu con más factores que la posibilidá d'hibridar en simpatría —el "conceutu d'especie biolóxica" de Mayr—, pero que non siempres delimita unidaes discretes: la cohesión tien graos, les poblaciones comunicar ente sigo por "corredores" que les caltienen más o menos cohesives y quiciabes a distintu grau en cada aspeutu a evolucionar, entá ensin corredores los individuos de les poblaciones nun s'aparien al azar y apáriense o interactúan con más probabilidá colos individuos más cercanos a sigo mesmos, polo que priorizar factores distintos de la cohesión puede dar resultancies distintes. Inclusive si llegar a un alcuerdu nestos factores y graos, si los llinaxes consten d'un continuum espacial que correlacione con un continuum de cohesión, inda pueden ser estremaos n'unidaes de forma arbitraria.[140] Esto llevaría a clasificaciones incompatibles, cuando les sos delimitaciones asolápense.[120][141] Na busca de la categoría puede reconocese una cota inferior (una población que nun sobrevive ensin la so metapoblación, ye dicir que nun ye independiente, nun ye una especie) y una cimera (por casu, la descripción d'un xéneru nun tendría d'algamar pa esplicar cómo sobrevive cada unu de los sos llinaxes, cómo se caltien el so "continuidá" nel tiempu). Esa busca siquier anguaño paez ser infructuosa en dellos taxones, especialmente microbios de reproducción asexual, que la so cohesión paez ser un continuum, nel que toles categoríes paecen ser arbitraries.[140]

De los conceutos d'especie, que son "casi tantos como especialistes dispuestos a aldericalos", dos tuvieron importantes implicancias na estabilidá de la nomenclatura y nes cañes de la ciencia que los utilicen.[120] Unu ye'l "conceutu d'especie biolóxica" o BSC (biological species concept[cita 35]), que delimita a la especie como'l grupu de poblaciones que puede hibridar ente sigo y dar descendencia fértil, que nun subdivide les comunidaes reproductives nun siendo que se caltengan aisllaes en simpatría, y ye el conceutu más utilizáu, o siquier el más invocáu, dende la so articulación por Y Mayr nos 1940-1960 hasta los 1980-1990; l'otru que ganó popularidá nes últimes décades ye'l "conceutu d'especie filogenética" o PSC (phylogenetic species concept[cita 36]), qu'estrema les comunidaes reproductives nun granu más finu según si caltienen calteres nun analís de filoxenia, y en munchos taxones, inclusive en dalgunos que paecíen bien estables como Primates, se superpuso la so clasificación a la del BSC.[120]

Una de les intenciones del BSC como formuláu por Y Mayr yera en parte embrivir el tracamundiu causáu pol ensame de ecotipos[142] dientro de les especies biolóxiques.[113] Esto ye porque la práctica habitual ye que se describan les especies d'una pequena rexón dada, que nesa rexón tán bien aisllaes reproductivamente ente elles, pero nos intentos d'integrar la información ente rexones ye común atopar un continuum de tipos intermediarios.[140] Sicasí, el BSC, fora de los taxones de vertebraos de tamañu grande a los que Mayr taba avezáu, nun resultó delimitar taxones con tanta precisión como paecía, ente les especies biolóxiques puede haber distintos graos na capacidá d'hibridar y quiciabes nun 10% de les especies biolóxiques d'animales, un 25% de les especies biolóxiques de plantes y un porcentaxe más altu de microbios atópense híbridos y non necesariamente con especies hermanes;[140] polo qu'entá sol BSC siguen atopándose diferencies ente taxónomos a los que se denominó "divisores" (splitters) y "agrupadores" (lumpers) ([120] mesma terminoloxía qu'en taxones cimeres[143]:238-241), ente que nos continuum sigue esistiendo'l problema de los solapamientos. Habiendo decidíu utilizar esi conceutu d'especie, inda se suman a la incertidume les inconsistencies históriques ente la delimitación práctica —de normal fenética— y la muncho más costosa delimitación conceptual de les especies.[140] El requerimientu clave p'arreglar estes diferencies ye que los taxónomos sían esplícitos alrodiu de qué conceutu taxonómicu y qué métodu p'algamar el so delimitación tán siendo utilizaos, de forma de poder superponerlas y utilizales sincronizadamente cuando eventualmente atópase más d'una clasificación describiendo la mesma rexón.[120][140]

Nomenclatura biolóxica[editar | editar la fonte]

L'últimu pasu nuna clasificación consiste en buscar qué nome científicu correspuénde-y al taxón o pescudar si precísase publicar unu nuevu, y eso fai según les riegles escrites nos Códigos Internacionales de Nomenclatura. Por razones históriques hai unu pa cada disciplina: de Zooloxía,[31] de Botánica,[29] y de Bacteries,[30][nota 10] y actualícense frecuentemente como resultáu de los Congresos Internacionales qu'axunten a los científicos pa tal efectu. Por casu, a xunetu del 2015 l'últimu Códigu de Botánica ye'l de Melbourne (revisión 2011, publicáu en 2012[29]), el postreru de Zooloxía ye la cuarta edición (revisión 1999, publicáu nel 2000[31]), y el postreru de Bacteries ye la revisión de 1990 (publicáu en 1992[30]). Les ediciones pueden nun ser la última versión, yá que se publicaron darréu enmiendes. Los Códigos tienen delles diferencies ente sigo, pero na so esencia funcionen de forma similar. Col oxetivu, y el "principiu básicu",[19] de "estabilidá na nomenclatura"[cita 37] el autores de los Códigos numberen los sos principios,[cita 38] de los qu'el "Principiu de Prioridá" consiste en que cada taxón cola so circunscripción, posición y rangu tien de tener el primer nome de los establecíos para él como únicu "nome aceptáu" ("nome correctu" en Botánica, "nome válidu" en Zooloxía) pa la comunicación.

El principiu de prioridá ye senciellu d'espresar, lo dificultuoso ye decidir cuándo dos autores tán refiriéndose al mesmu taxón y cuándo a unu distintu, o dichu con más rigor, lo dificultuoso ye decidir, cuando un nuevu autor camuda les hipótesis taxonómiques de forma de recircunscribir los grupos o camudalos de posición o rangu, cuál de los nuevos taxones tendrá d'utilizar un nome yá utilizáu nel pasáu. Los Códigos deciden que'l nuevu taxón que "herieda" el nome ye'l que contien el mesmu tipu dientro d'él. Los Códigos busquen que cada descripción, cada conceutu taxonómicu o cada conxuntu de subtaxones que yá foi nomáu siga col mesmu nome no posible. D'esta forma los Códigos definieron lo qu'en nomenclatura se llama'l "taxón nominal":[cita 39] l'asociación permanente ente un "nome" y un "tipu", esti postreru establecíu, nestos Códigos, nuna categoría taxonómica primaria dada. Esta asociación perdura al traviés de los cambeos de circunscripción, necesaria pa establecer y reutilizar el taxón nominal pero variable ente autores; al traviés de los cambeos de posición taxonómica, que na categoría especie lleva a un cambéu nel nome; y al traviés de los cambeos de categoría si camudar a una categoría cercana que caltien el tipu (del mesmu "grupu de categoríes"), que de normal lleva tamién dalgún cambéu nel nome.[cita 40]

Especímenes tipo
En plantes, polo xeneral el "espécime tipu nomenclatural" ye un exemplar completu de la especie que foi colectado y herborizado (entartallándolo ente papeles de diariu que se camuden tolos díes hasta que dexen d'amugase), y depués depositáu nun yerbariu accesible al públicu, como los de los xardinos botánicos.

El "tipu", el conteníu del taxón que s'afita permanentemente al nome, ye daqué distintu si tamos falando d'un nome na categoría especie o inferior, o d'un nome d'una categoría cimera a especie. Nestos Códigos, na categoría especie o inferior a especie (les categoríes del grupu especie), "l'espécime tipu nomenclatural" ye un espécime específicu de la especie idealmente completu, en bones condiciones, y depositáu nuna colección que la so mantención y crecedera sían empobinaos por un taxónomo especializáu (un curador), quien tendría de dexar al públicu un accesu a los tipos anque sía acutáu. Cuando ye posible, los tipos depositar n'instituciones dedicaes a la ciencia como museos d'hestoria natural y xardinos botánicos. Cuando'l tipu utilizáu na publicación orixinal (el "holotipo") perdióse o vueltu irreconocible, nun hai otru espécime de la colección orixinal que pueda reemplazalo (un "lectotipo"), y hai necesidá d'un tipu pa reutilizar un nome, el nome nun se pierde sinón que puede escoyese de los especímenes identificaos col mesmu nome y localidá que l'orixinal, un "neotipo"[cita 41]. Nos casos particulares de bacteries[cita 42], protozóos[cita 43], algues y hongos[cita 44] que les sos colecciones consten de cepes vives, el tipu nun ye un únicu organismu muertu sinón que ye una cepa cultivada viva, polo xeneral conxelada, y disponible en siquier una[cita 42] o dos[cita 44] colecciones distintes según el Códigu.

Ficheru:Tipos nes categoríes d'especie, xéneru y familia.svg
Espécime tipu y el so allugamientu na categoría d'especie (en blancu los "especímenes de referencia" depositaos en colecciones y non portadores de nomes) y la so correspondencia col tipu nominal (portador del nome) nes categoríes de xéneru y familia. La distancia ente especímenes nel planu representa cuántu s'estremen en términos de los sos calteres, que suel correlacionar col allugamientu xeográficu na que foi colectado cada unu. La llende inferior de la composición d'organismos de xéneru y especie "tipu" incluyíos na familia ye'l mesmu espécime del taxón nominal; pero nun hai nenguna obligación nos Códigos d'incluyir la circunscripción de la especie nel xéneru, nin la del xéneru na familia, cuando ésta ye establecida. Les úniques llendes impuestes polos Códigos a la circunscripción del xéneru ye la dada polos tipos esternos a la circunscripción de la familia que fueren establecíos enantes a la fecha del tipu aceptáu; son los mesmos llendes impuestos pa la especie en relación al xéneru.

Con al respective de los taxones cimeros a especie, el nome del xéneru —y de les demás categoríes del grupu xéneru— tien como "tipu" al taxón nominal d'aquella especie contenida nél que foi publicada primero; y el nome d'una familia —y de les demás categoríes del grupu familia— tien como "tipu" al taxón nominal del xéneru conteníu nella que foi publicáu primero. Nótese que nestos casos el "taxón nomáu" ye un grupu de organismos que'l so tipu ye un xéneru o una especie conteníos nél, anque, como ta nomáu según les riegles formales de nomenclatura, el tipu contien de la mesma un espécime tipu o un taxón que eventualmente añerar. Colos cambeos de circunscripción, esi espécime ye l'únicu que se caltien necesariamente dientro de les llendes de cada taxón de cualquier categoría.

Si dientro de la estensión[nota 11] (la composición d'organismos) del taxón nun hai nengún exemplar especificáu como "tipu", l'autor de la circunscripción puede decidir nomala formalmente, esto ye, crear un taxón nominal que va pasar al terrén de los "nomes científicos" pol restu de la hestoria de la taxonomía. El tipu va ser un exemplar identificáu dientro de la estensión del taxón, debidamente depositáu nuna colección, y el nome va ser un nome en llatín o latinizado construyíu según ciertes riegles explicitadas nos Códigos (dalgunes de les cualos van vese más embaxo). Tolos datos del nuevu taxón (el nome, la posición, la categoría taxonómica, la descripción o la diagnosis escrita en forma de calteres espresaos en palabres, los datos del allugamientu del tipu) son "efectivamente publicaos" si ser onde sían accesibles pa otros científicos y espertos locales, como una revista científica, o un llibru. Nun se consideren efectivamente publicaos los nomes publicaos en medios efímeros de publicación como un catálogu de granes, un diariu, o per corréu electrónicu. Toos estos datos efectivamente publicaos converten al taxón nominal nun nome establecíu[cita 45] ("válidamente publicáu" en Botánica, "disponible" en Zooloxía), y ye cuando dicimos qu'un nome tien el estatus de "nome científicu" o de "nome formal".[cita 46]

Ficheru:Sinónimu taxonómicu y nomenclatural.svg
Los dos tipos de sinonimia son los sinónimos suxetivos (Zooloxía), taxonómicos o heterotípicos (Botánica): los nomes que compiten por un mesmu taxón, y los sinónimos oxetivos (Zooloxía), nomenclaturales o homotípicos (Botánica), tolos taxones que "herieden" el mesmu nome, col mesmu autor orixinal y distintu autor de la descripción (nótese qu'estos postreros nun son verdaderos "sinónimos", son en realidad palabres ambigues). Nos casos de les especies, pa les que queda explicitada la posición taxonómica (nesti casu'l xéneru al que pertenecen) nel nome, cuando una especie "herieda" el taxón nominal nun xéneru distintu que l'orixinal, créanse dos nomes científicos con distintu xéneru y mesmu epítetu, col mesmu autor orixinal y distintu autor de la posición taxonómica, anque tuvieren la mesma circunscripción; l'ambigüedá ta nel taxón nominal y namá se repara nel epítetu del nome; el "nome" que-y correspuende a los dos taxones nun ye un nome sinónimu porque son dos taxones distintos.[cita 47]

Cuando s'atopa más d'un "tipu" dientro del taxón, los demás nomes pasen a ser sinónimos taxonómicos del primeru, el "nome aceptáu" ("nome correctu" en Botánica, "nome válidu" en Zooloxía) del taxón. Pero si al afayase esti fechu un nome más recién yá ta bien estendíu, puede proponese a la Comisión respectiva como esceición de primeres de prioridá y n'ares de la estabilidá, amestar el nome a la llista de noma conservanda, nomes que se consideren el nome aceptáu por razones práctiques.

Los nomes tamién pueden ser establecíos pero ilexítimos. Esto ye porque les riegles enunciaes pa establecelos nun torgaron la so formación, pero afayar que nun cumplen colos principios, los que s'intenten cumplir por aciu les riegles y que son enunciaos na primer parte de cada Códigu. Por casu los principios más importantes pa caltener la estabilidá na nomenclatura son que tien d'haber un solu nome pa cada taxón, y el principiu de prioridá. Los dos razones principales poles qu'un nome puede ser ilexítimu son que al momentu de la publicación nun s'evitó que (a) fuera redundante, ye dicir que l'autor establez un nome científicu pa un taxón que na composición d'organismos tien un exemplar que yá forma parte d'un taxón nominal y ye asina d'una forma "evidente", y (b) que fuera homónimu —non sinónimu— d'otru anterior, ye dicir qu'un "nome" que yá formaba parte d'un taxón nominal fuera acomuñáu a un "tipu" nuevu. Mientres nun haya un rexistro central de nomes incluyíu nes riegles estes situaciones nun son evitables por aciu elles, y a pesar de que lo intenta nun son inda fáciles de detectar, publicar miles de nomes nuevos per añu[153] y namá se llogró establecer un rexistru central mandatariu de nomes y publicaciones en bacteries, qu'esiste dende 1980.[154] Nun se terminaron de informatizar los datos de la lliteratura publicada en papel pa indexarlos en bases de datos dixitales, y botánicos y zoólogos non consensúan la creación de "índices de nomes adoptaos"[154] ("non suprimíos", dexando los nomes non indexados suprimíos por defectu) nos taxones que los toquen por medrana a qu'unos pocos especialistes dexen publicaciones fora de la indexación y atropen la nomenclatura d'un grupu.[141]

Cuando l'aplicación estricta d'un Códigu resulta en desestabilización de la nomenclatura, o nun cumple los Principios, como s'argumenta cuando se realicen propuestes de caltenimientu de nomes o de supresión de nomes ruinamente establecíos, la situación preséntase ante la so Comisión respectiva, que tien la responsabilidá de tomar una decisión al respeutu.[cita 48] La composición y funciones de cada Comisión tán contemplaes nel so respectivu Códigu, y tantu les propuestes como les decisiones tomaes en relación a elles son publicaes na so respectiva revista especializada. Les decisiones tomaes pola Comisión Internacional de Nomenclatura Zoolóxica son publicaes na so revista, The Bulletin of Zoological Nomenclature,[155] les tomaes polos Comités auspiciados pola Asociación Internacional pa la Taxonomía de Plantes (IAPT) son publicaes na so revista, Taxon,[156] y les tomaes pol Comité Internacional de Sistemática de Procariotas y Bacterioloxía son publicaes na so revista, el International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM).[157]

Finalmente, la nomenclatura botánica, la nomenclatura zoolóxica y la nomenclatura bacteriolóxica son independientes la una de la otra, (con pocos taxones salvaos[nota 12]?). De resultes, el mesmu nome puede ser utilizáu pa una planta, pa un animal o pa una bacteria, ensin que sían formalmente nomes homónimos, y anque nun ye lo aconseyable anguaño animales y plantes pueden tar compartiendo'l 13% de los sos nomes na categoría de xéneru.[158]

Categoría taxonómica[editar | editar la fonte]

Artículu principal: Categoría taxonómica
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Penriba de reinu nun hai categoríes propuestes nos Códigos, los taxónomos que les utilicen pueden faer usu informal del Dominiu, el Superreino o'l Imperiu.

Nos Códigos de Nomenclatura, son siete les categoríes primaries o principales:[cita 49] Reinu, Filu o División, Clase, Orde, Familia, Xéneru, Especie. Históricamente, el Códigu de Zooloxía utilizó la categoría Filu (Phylum n'inglés y en llatín), y el Códigu de Botánica y el de Bacteries biforcáu d'él, la de División (Division, n'inglés, Divisio en llatín), anguaño nuna dirección escontra l'harmonización tratar como sinónimos.[cita 49]

Una riegla mnemotécnica pa recordales ye la siguiente:

L'establecimientu d'un nome nuna categoría primaria xenera un "tipu" no que los Códigos llamen el "grupu de categoríes" que toma toles categoríes entemedies penriba y per debaxo de la categoría primaria, que van tener, xustamente, el mesmu "tipu". Estos taxones van ser establecíos cuando los publicar per primer vegada, cola so respectiva circunscripción.[cita 49]

Depués d'establecer les categoríes primaries pueden entrepolase dalgunes categoríes secundaries, pero a diferencia de les primaries éstes son optatives, y nun ye necesariu entrepolales a lo llargo de tola categoría nuna clasificación, pero una vegada que decidió amestase una categoría secundaria a un taxón primariu, sí ye necesariu amestala a lo llargo de too esi taxón. Son tribu ente familia y xéneru (perteneciente al grupu familia), sección ente xéneru y especie (perteneciente al grupu xéneru), y les qu'utilicen prefixos: superfamilia, subfamilia.[cita 49] La categoría de subtribu namá puede establecese dempués de la de tribu, y la de subsección dempués de la sección. Les categoríes secundaries propuestes per cada Códigu van presentar na sección siguiente.

Ficheru:Exemplu d'usu de categoríes secundaries-01.svg
Les categoríes secundaries entrepolar de forma de caltener los conceutos taxonómicos nel rangu que-yos correspuende, na opinión d'un autor.

Nome científicu[editar | editar la fonte]

Artículu principal: Nome científicu

Nos Códigos de Nomenclatura, cada especie queda designada por un binomiu (una espresión de dos palabres) en llatín, onde la primer palabra, el "nome de xéneru", ye compartida poles especies del mesmu xéneru; y la segunda, el "axetivu específicu" o "epítetu específicu", fai alusión a dalguna característica o propiedá distintiva d'esa especie en particular, como pueden ser el color (albus, ‘blancu’; cardinalis, ‘coloráu cardenal’; viridis, ‘verde’; luteus, ‘mariellu’; purpureus, ‘púrpura’; etc.), l'orixe (africanus, ‘africanu’; americanus, ‘americanu’; alpinus, ‘alpín’; arabicus, ‘arábigu’; ibericus, ‘ibéricu’; etc.), al hábitat (arenarius, ‘que crez nel sable’; campestris, ‘de los campos’; fluviatilis, ‘de los ríos’; etc.), un homenaxe a una personalidá de la ciencia o de la política o atender a cualesquier otru criteriu. Nun ye necesariu que'l nome tea en llatín, namá ye necesariu que tea latinizado. Los nomes de xéneru siempres van cola primer lletra en mayúscules, los epítetos específicos siempres van en minúscules, y los nomes de xéneru y d'especie van siempres n'itáliques (o sorrayaos, si escríbese a mano).[nota 13] Al escribir el nome d'especie, l'epítetu específicu nunca ye utilizáu solo, y ye mandatariu que tea precedíu pol nome del xéneru, de forma que'l nome de la especie sía'l binomiu completu. La abreviación a la primer lletra del nome del xéneru precediendo l'epítetu específicu completu tamién ye aceptable una vegada que'l nome yá apaeció na so forma completa na mesma páxina o nun artículu pequenu. Asina por casu, el merucu de tierra foi llamada Lumbricus terrestris por Linneo, y si el nome yá apaeció antes nel artículu y nun hai ambigüedá, puede volver referise a ella como L. terrestris. Con al respective de los taxones allugaos na categoría de xéneru y superior, los nomes son uninomiales (consten d'una sola palabra) y siempres s'escriben cola primer lletra en mayúscules (anque solamente na categoría de xéneru van n'itáliques[nota 14]). Como los Códigos de Nomenclatura prohiben que dientro de cada Códigu haya dos taxones col mesmu nome, nun puede haber dos xéneros col mesmu nome (nin dos taxones penriba de xéneru col mesmu nome), pero como asocede que l'epítetu específicu de les especies namá s'usa dempués del nome del xéneru, puede haber dos especies distintos pertenecientes a xéneros distintos que compartan el mesmu epítetu específicu. Una vegada fitu, un nome nun ye sustituyíu por otru ensin un motivu nomenclatural. Por casu el carbayu de la contorna de Madrid foi bautizáu como Quercus pyrenaica equivocadamente, cuidao que nun s'atopa nos Pirineos, pero tal circunstancia nun xustifica un cambéu de nome.

L'encamientu ye que los nomes sían fáciles y descriptivos,[cita 52] y a qu'usen esi curiosu coles mires de que sían utilizaos una parte significativa de los usuarios finales dedicó Linneo munches de les sos secciones en Philosophia Botanica[142]; pero nun hai riegles que torguen a'l investigadores utilizar el so propiu maxín pa crear los nomes científicos más insólitos: el nome de la araña Pachygnatha zappa, porque tien un llurdiu nel abdome igual al bigote del artista Frank Zappa; dalgunes moscas chupadores de sangre del xéneru Maruina: Maruina amada, M. amadora, M. cholita, M. rapaza, M. quería, M. chamaca, M. chamaguita, M. moza, M. dama, M. nina, M. tica y M. vidamia, toos axetivos cariñosos; el dinosauriu que foi llamáu Bambiraptor debíu al Bambi de Disney; el moluscu bivalvu Abra cadabra (anque dempués camudar de xéneru); y quiciabes el casu más sobresaliente, el xéneru d'arañes brasileñes Losdolobus, llamáu asina porque los investigadores que lu describieron, queriendo homenaxar a dos arxentinos que collaboraren, pidiéron-yos a éstos qu'inventaren un nome pal nuevu xéneru, que quedó como Losdolobus por "los dolobus", términu del lunfardo arxentín intraducible nuna enciclopedia.[161]

Los Códigos nuna de los sos encamientos faen un llamáu a la responsabilidá, "El autores tendríen d'exercitar un razonable curiáu y considerancia na formación de nomes nuevos p'asegurase de que son escoyíos colos sos subsecuentes usuarios en mente y que, mientres sía posible, sían apropiaos, compautos, eufónicos, fáciles de memorizar y nun causen ofiensa".[cita 52]

Nes categoríes cimeres a xéneru los nomes científicos son la raigañu del tipu (un xéneru del taxón, nos rangos más baxos el más antiguu) con un sufixu que denota la categoría na qu'el taxón foi allugáu,[cita 53] según indícase na siguiente tabla:

Categoría taxonómica !style="background:#f3f3f3;"|Plantas Algas Hongus Animalye
(Rev.1999[31])
Bacterias
(Rev.1990[30])
(Rev.2011[29])
Grupu Filu División / Filo -phyta[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -phycota[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -mycota[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] -
Subdivisión / Subfilo -phytina[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -phycotina[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -mycotina[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] -
Grupo Clase Clase -opsida[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -phyceae[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -mycetes[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] Nome descriptivu[cita 56]
Subclase -idae (pero non -iridae)[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -phycidae[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] -mycetidae[cita 54] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] Nome descriptivu[cita 56]
Grupu Orde Orde -ales[cita 57] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] -ales[cita 58]
Suborde -ineae[cita 57] o nome descriptivu[cita 53] Hai encamientos nel BioCode.[cita 55] -ineae[cita 58]
Grupo Familia Superfamilia - -oidea[cita 59] -
Familia -aceae[cita 60] -idae[cita 59] -aceae[cita 58]
Subfamilia -oideae[cita 61] -inae[cita 59] -oideae[cita 58]
Tribu -eae[cita 62] -ini[cita 59] -eae[cita 58]
Subtribu -inae[cita 62] -ina[cita 59] -inae[cita 58]
El color coloráu indica la categoría primaria y el grupu de categoríes xeneráu por ella. L'azul indica les celdes pa les que'l principiu de prioridá na elección del xéneru tipu ye mandatariu en cada Códigu. Les celdes dexaes en blancu indiquen que nun ta formalizada esa categoría nel Códigu dáu.

Un "nome descriptivu" ye por casu Monocotyledoneae ("un cotiledón"), o un nome con un raigañu descriptivu en llugar de derivar d'un xéneru tipu como Coniferales (raigañu: "Conifer-" sufixu: "ales").[cita 53] Estos nomes nun tán acomuñaos a un xéneru "tipu" en Botánica, sinón a la descripción inferida del nome (p.ej. les monocotiledónees pueden recircunscribirse de forma de dexar cualesquier de les sos subtaxones fuera del grupu, pero tener "un cotiledón"), sicasí sí tán acomuñaos a un xéneru tipu en Bacteries, amás d'a la descripción inferida del nome[cita 53]. Los Códigos llamen a los nomes descriptivos ensin xéneru tipu typeless ("ensin tipu"), dellos autores prefieren definir como "tipu" al conteníu del taxón que tea acomuñáu al nome nun taxón nominal, polo que la descripción inferida d'un nome descriptivu sería tamién un "tipu". Nótese qu'esta riegla difier de la de taxones inferiores, nos que la descripción inferida del nome descriptivu nunca s'amiesta al "tipu". Amás en taxones cimeros al grupu familia, o superiores al grupu orde en bacteries, nun ye mandatariu que'l xéneru escoyíu como "tipu" sía'l primeru de los nomaos en riegla.

Un exemplu de taxón ye l'orde Primates. Nesta espresión, "orde" especifica la categoría taxonómica del grupu, más abarcativa que la categoría de familia y menos abarcativa que la de clase. "Primates" ye'l nome del taxón. L'orde Primates ta incluyíu na clase Mammalia (los mamíferos), y de la mesma inclúi diverses families como la familia Cebidae (cébidos, les mones americanes) o la familia Hominidae (homínidos, la familia que nos inclúi como especie).

Per debaxo de la categoría especie atopen la subespecie, variedá y forma, toes categoríes pertenecientes al "grupo especie". El so nome armar col nome de la especie siguíu de subsp. o de var. o f. (ensin itáliques) respectivamente, siguíu d'un epítetu subespecífico n'itáliques: Carpinus caroliniana subsp. caroliniana, Lyonia ligustrina var. ligustrina, salvu nes subespecies d'animales que nun lleven la partícula subsp: Canis lupus familiaris. Son nomes trinomiales.

Amás, en tolos taxones, la primer vegada que se noma un taxón nuna publicación científica, el nome científicu puede trate siguíu del apellíu del autor de la so descripción (de normal llamáu la "autoridá"), meyor entá si siguir del añu en qu'el taxón foi descritu. El nome del autor puede tar embrivíu, por casu a Linneo embrivir con una L.. Les vegaes posteriores que se noma al taxón na publicación evita l'autor y l'añu de publicación. Dacuando atópense variaciones na forma en qu'autor y añu son escritos (por casu hai dos autores conectaos por palabres en llatín como in o et o ex, o l'autor ta ente paréntesis), y cada una d'estes variaciones tien el so significáu en Nomenclatura. Por casu, nel casu de los animales, si na actualidá una especie en particular ta allugada nun xéneru distintu al que-y foi asignáu pola so autoridá orixinal, el nome del autor y l'añu poner ente paréntesis indicando asina que originalmente describir con otru nome. Asina, el lleón na actualidá ye Panthera lleo (Linnaeus, 1758), y ponse autor y añu ente paréntesis porque Linneo describir originalmente como Felis lleo. L'autor y añu de publicación nun son riegles sinón encamientos de los Códigos de Nomenclatura, pero son d'usu corriente na lliteratura y encamentaos por munchos autores. Cuando se fai referencia a la circunscripción d'un conceutu taxonómicu utilizáu na actualidá que difier de la circunscripción de la publicación del taxón nominal, puede atopase el conector sensu[162] (p.ej. "Arenaria sensu McNeill (1962)"). L'autor y añu del taxón nominal orixinal caltiénense preseos pa evitar erros con nomes homónimos, y esperablemente nel futuru ambos autores puedan reemplazase por un Identificador Global de Conceutos Taxonómicos (de nomes según cada autor, como originalmente utilizar Linneo[142]), que cuando se resuelva emponga a la cita del conceutu utilizáu con toles sos referencies y quiciabes un enllaz a la publicación.[34][163][162]

¿Por qué camuden los nomes de los taxones?[editar | editar la fonte]

La descripción formal y la tipificación de los taxones son procedimientos nos que ye frecuente reparar erros ya inconsistencies, y esto asocedía entá en mayor midida primero que los Códigos Internacionales reglamentaran estos trabayos bien pormenorizadamente. Los nomes de los taxones pueden camudar cuando son redescubiertas descripciones más antigües del mesmu taxón, y aplícase el principiu de prioridá, o cuando se repara que la descripción orixinal en realidá refería a un taxón distintu. Nun suelen dase estos casos nos grupos yá bien estudiaos, y nos Códigos hai amás mecanismos pa la supresión de nomes ruinamente definíos nos grupos más complicaos. Una vegada asitiada la taxonomía fundamental d'un grupu, ye pocu probable que los cambeos de nomes dar por esta clase de motivos.

Los nomes camuden cuando'l descubrimientu de nueva información obliga a modificar les circunscripciones, pero tamién —y ensin necesariamente nueva información que lo xustifique—, los nomes camuden por diferencies de criteriu ente los especialistes.

Por casu, ye bien común qu'a distintos grupos d'organismos recién descubiertos déase-yos nomes de especie (y de xéneru inclusive) nuevos y qu'años dempués un taxónomo que los estudie llegue a la conclusión de que toos pueden hibridar ente sigo y dar descendencia fértil, y unifique tolos taxones nuna única especie (nesti casu tolos nomes camuden al nome de la primer especie descrita dientro del grupu), dexando, sía que non, los antiguos epítetos d'especies como subespecies. Con posterioridá puede llegar otru taxónomo que considere qu'esos grupos d'organismos tendríen d'estremase en dos especies distintes, que na naturaleza conviven ensin hibridase (anque pudieren), por cuenta de que cada una de les especies qu'él propón forma una unidá monofilética nun analís de filoxenia. Entós a los que s'encuadren na "nueva" especie, camúdase-yos el nome d'especie pol nome de la especie más antigua descrita dientro de la "nueva" especie. Otru taxónomo podría argumentar más tarde que tolos grupos originalmente descritos son especies válides del mesmu xéneru, por cuenta de que cada unu d'ellos pue ser identificáu pol so propiu grupu de calteres morfolóxicos, y que dientro de cada unu d'ellos hai un patrón d'ascendencia y descendientes. Nesti casu, tolos epítetos d'especies camudaríen al primer epítetu dáu a cada grupu cuando foi descritu, pero tolos nomes de xéneru unificar n'unu solu, polo que tolos xéneros pasaríen a nomase como'l xéneru más antiguu descritu dientro del grupu. Esta inestabilidá de los nomes produciríase casi namá por cambeos de "filosofía taxonómica": el "conceutu taxonómicu" que cada autor considera que se correspuende cola categoría especie. Estes diferencies conceptuales ente taxónomos son desaxeradamente comunes anguaño, lo cual lleva a una gran inestabilidá potencial nos nomes de los taxones (Vane-Wright 2003[164] citáu en Mallet y Willmott 2003[141]).

Determinación o identificación de especímenes[editar | editar la fonte]

Ficheru:Little Haven Nature Acute, sweep-netting - geograph.org.uk - 1581841.jpg
Captura d'insectos voladores nel estratu herbal. La primer actividá d'un aspirante a conocer la taxonomía de la so rexón ye xenerar una colección, productu de coleutes periódiques en toles estaciones del añu, clasificada hasta que llogra segregar informalmente los cientos o pocos miles d'especies o morfotipos nativos y adventicios presentes na so localidá, y establecer les "diferencies" ente los más cercanos conceptualizando los sos calteres.[142] El pasu siguiente ye la comparanza colos nomes formales, con ayuda d'un taxónomo especializáu o cola bibliografía taxonómica encamentada por él. ([142])
Caxa entomolóxica de dípteros, contien una plancha de telgopor na que s'enserten los anfileres entomolóxiques nos que tán montaos los dípteros y les sos etiquetes. L'aspirante tien de tener conocíos tolos grupos "naturales" penriba de xéneru o de familia (n'este caso orde Diptera, mosques y mosquitos) pa realizar esti pasu al ordenar la so colección. ([142])

La disciplina de la Determinación, o identificación de especímenes, ye'l procesu de reparar los calteres d'un especímen hasta atopar el taxón nel que s'alluga ("determinalo") o reconocer que ye nuevu pa la ciencia y precisa una descripción formal y un nome. Como namá'l 10 % de les especies del planeta ta descripto, y eses descripciones son hipótesis con distintos graos de resolvimientu[cita 8][165], la Determinación funciona recursivamente cola descripción y delimitación d'especies na área llamada alfa-Taxonomía o Taxonomía Descriptiva, o, modernamente y deslindando les diferencies nes definiciones de Taxonomía —dende va décades con una definición minimalista— y Sistemática, y por cuenta de que se intergraban nesa categoría taxonómica, la área de la "Sistemática Descriptiva"[23] o "Ciencia de la Biodiversidá"[cita 6]. Esta área ocúpase amás de la investigación espedicionaria y exploratoria n'ambientes naturales p'avanzar nel descubrimientu, la identificación, la descripción, la clasificación y la catalogación de la biodiversidá del planeta, utilizando como unidá de trabayu l'organismu y que la so prioridá[24] ye la descripción de les especies dientro d'un contestu evolutivu, averándose a ello dende la investigación primaria sobre un grupu taxonómicu dadu, un gremiu ecolóxicu, o una rexón xeográfica;[cita 6] ocupar de realizar nueves coleutes (el "trabayu de campu") y depositales en colecciones, del trabayu de toma de datos sobre les colecciones esistentes, de la realización de clasificaciones revisionarias, de desenvolver hipótesis taxonómiques (determinación d'homoloxíes, calteres, apomorfías y plesiomorfías, especies, clados[24]), de testear les hipótesis taxonómiques d'especie, y la creación y usu de les ferramientes informátiques necesaries pa tou ello y pa publicar les nueves claves d'identificación y les nueves descripciones, coles qu'en xunto se llega a los taxones redefiníos, que xunto col desenvolvimientu teóricu de les hipótesis formen parte de la lliteratura taxonómica primaria, que los sos productos más acabaos[23] son les llamaes floras, faunas y monografíes taxonómiques.[cita 6] N'árees onde la biodiversidá presenta una xera griespa, como nos trópicos debíu al númberu d'especies y tamién al vastu númberu d'especies que nun foi entá publicáu, o exhaustivamente fotografiáu– el rol del especialista, profesional o espertu local, na determinación ye críticu. ([18]:7)

Amás de la finalidá en sí mesma de xenerar una taxonomía sólido y estable, hai delles otres razones poles que puede precisase una determinación, y toos si tán correchamente documentadas y los exemplares depositaos en colecciones con accesu al públicu xeneral y a la comunidá científica, apurren datos a l'alfa-Taxonomía. Los taxónomos precisen identificar los organismos sobre los qu'estrayen nueves llínees d'evidencia coles qu'afaer los analises de filoxenia en taxones de categoríes más altes, y a pesar de que s'escueye pa les sos muestreos a los especímenes que se consideren bien determinaos tampoco faltó dalgún erru na filoxenia por un erru d'arrastre de determinación[167]. En Biogeografía utilícense los datos de especímenes identificaos por localidá o "escurrimientos", lo que se llama "datos georreferenciados", nos analises[168], que les sos conclusiones de la mesma pueden debilitar o guarnir hipótesis taxonómiques. Munchos trabayos d'investigación realizaos por biólogos ecólogos impliquen un conteo de dalguna unidá taxonómica de biodiversidá en cierta área, como nes investigaciones rellacionaes col caltenimientu,[169] o nes rellacionaes coles invasiones biolóxiques y el so impactu nel ecosistema, o nos cambeos en patrones de sucesión en relación a dalgún otru tipu de disturbiu. Una correcta identificación precísase cuando s'abarrunta qu'una enfermedá o muerte n'humanos, animales o plantes ye causada por un ser vivu, como cuando s'abarrunta que'l ganáu ta consumiendo una planta tóxica que-y produz enfermedá o muerte,[170][171] o cuando un animal selvaxe pica o muerde a un humanu, o un microbiu patóxenu infectar,[172] la correcta identificación nestos casos abre la lliteratura qu'indica les formes de control y tratamientu conocíes, y estos escurrimientos amestaos pueden analizase na busca de correlaciones y patrones predictivos. Los fabricantes de pesticidas y yerbicíes[173] y los servicios rellacionaos cola salú pública[174] pueden riquir un monitoreo d'insectos o plantes dañibles en cada zona coles mires de caltener regulada la so bayura y pa probar efectividá de tratamientos cuando decide aplicase los. Nel campu de la bioloxía forense la identificación de especímenes puede esclariar asuntos llegales.[175][176]

Ficheru:GBIF y BOLD escurrimientos n'Arxentina - setiembre 2016.png
Exemplu d'Arxentina. Total d'escurrimientos (tolos taxones, toles dómines) publicaes en GBIF (esquierda) y en BOLD (repositorio de la llínea d'evidencia ADN "barcode" COI, derecha), a setiembre del 2016. GBIF: 979 datasets totalizando daqué más d'un 1,8 millón de récords (escurrimientos).[177] BOLD: Casi 100 mil récords (escurrimientos) de los que daqué más del 5% ta determináu hasta especie.[178]

Si realizáronse identificaciones pa un trabayu que se ta por publicar, ye bona práctica[179][180] citar cuál foi'l taxónomo consultáu o les publicaciones taxonómiques que fueron utilizaes pa identificar les especies, y amestar una sección de Especímenes esaminaos[181] onde se cite l'allugamientu de los especímenes que fueron depositaos o visitaos na colección que los caltien como referencia (los voucher[182]) de los datos sobre los que se realizó la hipótesis publicada. La sección "especímenes esaminaos" tendría d'incluyir el nome científicu actual [o l'aceptáu sensu qué autor], el númberu d'identificación del especímen individual dientro de la colección (el accesion), el nome de la colección o la so acrónimo, la localidá onde foi colectado, y si llograr, los accession de les secuencies d'ADN publicaes por casu en GenBank.[181] Si foi publicáu'l dataset d'escurrimientos por casu en GBIF, puede citase l'allugamientu del mesmu nel repositorio públicu nel que foi compartíu o los escurrimientos dientro del mesmu utilizaes. Les colecciones de especímenes tienen una infraestructura específica pa cada taxón, y cada autor puede tener una colección privada —inclusive unicata (unicate collection[159]), con un solu especímen o llote, quiciabes holotipo o isotipo—, pero si ye posible agóspiense[183] n'instituciones públiques como museos d'hestoria natural o xardinos botánicos, que son los sitios más estables y facer perdurar por centuries, el taxónomo especializáu que dirixe la so mantención y crecedera –el curador– idealmente tendría de dexar al públicu un accesu a los especímenes anque sía acutáu. Les colecciones suelen tener catálogos electrónicos cola información de los especímenes que tienen, que son cada vez más fáciles d'aportar y, a pesar de que nos sos entamos escarecíen d'estandarización nos sos formatos, prevese que nel futuru munches d'eses bases de datos puedan ser aportaes por un mesmu portal, esperablemente por aciu los estándares TDWG. Unu d'esos portales, creáu nel 2001 por alcuerdos internacionales ente axencies gubernamentales dempués de la Convention on Biological Diversity (CBD) ye GBIF, qu'agospia tantu datasets compartíos dende los catálogos de museos y herbarios como datasets que se publicar acomuñaos a publicaciones científiques. Nes colecciones, nun ye raru que los especímenes se reclasifiquen si tán lo suficientemente bien documentados, calcúlase qu'un porcentaxe que puede aportar a d'hasta un 20% o un 25% de los especímenes puede ser reclasificado mientres el rechequeo (ver[179]); dalgunos d'ellos van poder ser designaos como'l "tipu"[183] d'un nome d'especie nueva o d'una yá nomada que'l so tipu orixinal perdióse[18][20][184][185]. Son cada vez más comunes los softwares que formatean la sección de especímenes esaminaos a partir de la planilla de datos, y tamién puede formatearse en forma de data paper un set d'escurrimientos pa publicación formal.

Coleuta[editar | editar la fonte]

Namá si les circunstancies dexar, porque pueden ser difíciles de colectar o tar en peligru d'estinción, los especímenes a identificar pueden colectarse con cuidu de nun estropiar nengunu de los sos calteres. Los especímenes nun tienen nengún valor si pierde'l datu de la localidá de la que s'estrayxeron y el momentu en que fueron atopaos, los datos de especímen/localidad-momento llámense escurrimientos, sían éstos colectados, fotografiaos o namá ingresaos como datu (lo que puede dexase según la confiabilidad del colector). Al colectar el especímen o al fotografialo realízase una ficha de colección con datos de localidá, fecha y colector; y otros que se van perder al llegar al llugar d'identificación como hábitat, si taba acomuñáu a dalguna otra especie, la so bayura nesa localidá, si yera de nueche o llovía, el métodu pol que foi colectado, y cualquier información sobre l'estáu del espécime que'l colector piense que pueda nun rescamplar una vegada llegue al so llugar d'identificación: fotografiar o anotar claramente'l color y testura de los órganos –que podría camudar por cuenta de la preservación–, anotar l'arume, etcétera ([18]:553). Si se coleuta más d'un espécime d'especies distintes, tien de faese una ficha de colección pa cada exemplar. Depués de la identificación tien d'amestase la mesma a la ficha y tamién quién ye l'identificador, que non necesariamente ye la mesma persona que fixo la colección, o cuálos fueron los métodos utilizaos pa la identificación (claves o colecciones coles que lo comparó), pa dexar lo más esplícita que se pueda la circunscripción utilizada pa esi nome aceptáu. Dempués d'una campaña tiense típicamente pa cada especímen, un id, una ficha de colección y un set de semeyes acomuñaos a esi id, un allugamientu na colección (una entrada o accession, non tolos especímenes fueron colectados y tienen númberu de accession, y hai entraes qu'alluguen un llote de dellos organismos similares colectados nel mesmu momentu, polo que correspuenden con dellos id de especímen), y esperablemente tamién tien acomuñada una llista de los estaos de los calteres que tien, necesarios pa llegar a la identificación y que fueron convenientemente dexaos por escritu en dalguna planilla estandarizada. Cada id de especímen representa una fila nuna colección de "escurrimientos". Si ingrésense les fiches nun formatu electrónicu, tien de prevese que cumpla colos estándares provistos pol Biodiversity Information Standards (enantes TDWG) pa facilitar el so accesu (ver l'estándar pa escurrimientos Darwin Core).

Identificación (Determinación)[editar | editar la fonte]

El primer pasu nuna identificación ye una observación a güeyu, qu'implica una apreciación inconsciente de munchos calteres del espécime coles mesmes, na que s'acomuñar l'espécime a ciertu taxón formal o informal (lo que se llama apreciación gestalt o holística del espécime[186]), los métodos más formales d'identificación entren en xuegu cuando'l comenenciudu precisa que la identificación siga hasta taxones más específicos, o cuando precisa confirmar una posible apreciación ([18]:6-7;[186]). Los métodos formales tienen en cuenta pocos calteres, espresaos amás de forma "tipolóxica"[187], resultando ser una simplificación de l'apreciación gestalt del taxónomo que los realiza; pero siempres que se dispon d'ellos, ye importante siguilos. Comparar directamente coles colecciones o les semeyes puede inducir erros, yá que nes semeyes pueden nun amosase o nun ser evidentes pal llector ensin entrenar los calteres qu'estremen el taxón de los demás.[173]

Los taxónomos concuerden en que la meyor forma ([20]:498) y la más rápida ([18]:6-7) d'identificar un espécime con métodos formales ye consultar a un especialista, sía profesional o espertu local, al que-y sían familiares la flora o la fauna de la rexón y que tea bien entrenáu y al tantu de les últimes actualizaciones publicaes sobre'l taxón. La determinación qu'él faiga va ser munches vegaes más esacta y actualizada que'l nome que l'usuariu final pueda llograr cola lliteratura y los preseos a los que tenga accesu ([20]:498).

Los preseos pa la identificación de plantes y artrópodos, por casu, son lente de mesa y elementos pa manipoliar l'amuesa na lente (dos aguyereties de disección y una pinza de punta fina), nel casu de les plantes un bisturín para seccionar órganos o una fueya d'afaitar, pue ser útil un calibre[18]:557 pa faer les midíes, y quiciabes saber faer preparaos pa reparar al microscopiu ([18]:557). Si amás tiense accesu a les fotografíes del especímen vivu o recién colectado la xera d'identificación vese facilitada. Raramente dos especies nun pueden discernise morfológicamente y débese recurrir a la unviada d'amueses pa la estracción y analís d'ADN.

Les ferramientes lliteraries pa la comparanza formal d'esos datos son les claves d'identificación, que faen usu de los estaos de los calteres del espécime pa refugar posibilidaes hasta llegar al nome del taxón[186]; d'elles el métodu más espublizáu anguaño ye la clave dicotómica ([18]:557).

Na clave dicotómica escuéyese siempres unu de dos caminos, dos descripciones mutuamente escluyentes de los estaos de dellos calteres. La elección unvia al usuariu al siguiente par de descripciones, hasta que, si l'usuariu nun cometió un erru, llegar al nome del taxón ([18]:558,[20]:496-497). La xera vese bien facilitada si la clave tien fotografíes del aspeutu de los estaos de los calteres.

Cquote1.svg Clave dicotómica de xéneros de la familia de les ninfáceas (una familia de nenúfares) (tomada de la Wikipedia):

  • Flores hipóginas. Ápice del xinecéu formando un discu planu a llixeramente cóncavu con estigmes radiales. Sépalos los 5-14. Polen anasulcado, espinosu.
Subfamilia Nupharoideae Mot. Ito, 1987.
Xéneru únicu: Nuphar Sm. in Sibth. & Sm., 1809. Holártico.
  • Flores períginas a epíginas. Ápice del xinecéu en forma de copa, tola so superficie estigmática. Sépalos los 4-5. Polen d'otru tipu.
Subfamilia Nymphaeoideae Arn., 1832.
  • Plantes con acúleos. Fueyes escutiformes, peltadas.
  • Cantu del llimbu llevantáu formando un reborde continuu. Viesu foliar aculeado. Estaminodios y apéndices carpelares presentes.
Xéneru Victoria Lindl., 1837. América meridional tropical.
  • Cantu del llimbu ensin llevantar. Fai y viesu foliares aculeados. Estaminodios y apéndices carpelares ausentes o inconspicuos.
Xéneru Euryale Salisb., 1805. Asia, de la India al Xapón.
  • Plantes ensin acúleos. Fueyes de diverses formes, peciolu enserto nuna escotadura del cantu del llimbu.
  • Sépalos los 4-5. Estambres pendilexos, epipétalos sobre la cara interna del tubu de la corola. Granes espinoses, ensin arilo.
Xéneru Barclaya Wall., 1827. Sureste d'Asia.
  • Sépalos los 4(-5). Estambres erectos, períginos sobre la cara esterna del tubu de la corola. Granes llises, papilosas o peloses, con arilo.
  • Pétalos 0-5. Exa floral central prominente percima de la copa estigmática. Fueyes somorguiaes lineares con cantos fuertemente ondulaos.
Xéneru Ondinea Hartog, 1970. Australia occidental.
  • Pétalos (6-)8-40(-50). Exa floral central visible como pequena proyección na base de la copa estigmática. Fueyes somorguiaes (si esisten) anches, de cantos apenes ondulaos.
Xéneru Nymphaea L., 1753. Cosmopolita. Cquote2.svg

La clave llámase politómica si danse más de dos opciones en cada bifurcación, ye una clave politómica en dos pasos la utilizada por Linneo en Species Plantarum (1753). Nel primer pasu pidía cuntar el númberu d'estambres, y nel segundu'l númberu d'estigmes.

Na clave multi-accesu o policlave, puede utilizase cualquier conxuntu de calteres en cualesquier orde, de forma que l'usuariu escueye los calteres utilizaos pa la identificación. Estes claves de normal contienen muncha más cantidá de calteres que les claves dicotómiques, y son bien ventaxoses cuando se tener un espécime incompletu o cuando se tien información incompleta sobre l'espécime. Escribiéronse programes d'ordenador de claves multi-accesu, en que de forma interactiva ingrésense los calteres y el programa devuelve los posibles taxones. Programes d'identificación asistíos por ordenador son por casu l'antiguu sistema DELTA ("Descriptive Language for Taxonomy") (Askevold y O'Brien 1994,[188] Dallwitz 1993,[189] 2000,[190] Dallwitz et al. 2002,[191] Pankhurst 1978,[192] 1991,[193] Watson y Dallwitz 1991,[194] 1993[195] citaos en Judd et al. 2007[18]) (güei superáu pol TDWG estándar SDD), na web pueden atopase otros como'l sistema LLUCÍI (Norton 2012[196]), y ye seguro que se van volver más importantes nel futuru[197]. Los programes sirven tantu pa utilizar claves yá esistentes como pa construyiles a partir d'una matriz de taxones × calteres, y tán afechos a que s'amiesten semeyes, videos y soníu. Anguaño, la mayor desventaxa de les claves multi-accesu ye'l so disponibilidad ([18]:558,[20]:496-497), anque yá hai qu'identifiquen les plantes de cualquier rexón del mundu hasta familia (como en colby[198], discoverlife[199]), formigues (antweb[200]), saltapraos (Common Western Grasshoppers[201]), camparines y polillas (Butterflies and Moths[202]), y munches inda tán siendo creaes (Farr 2006[203]). Hai esfuerzos crecientes pa computarizar les claves d'identificación, incluyíes les multi-accesu.[204]

Magar les claves informátiques son pervalibles, la mayor parte de les claves d'identificación inda s'atopa, xuntu coles respectives descripciones ya ilustraciones de cada taxón, n'enormes volumes en papel publicaos en series llamaes floras y faunas, qu'axunten la información sobre la presencia de les plantes o animales pertenecientes a una área particular, a una pequena rexón, o a tou un continente ([18]:560). Por casu, la primer flora de la taxonomía moderna, Species Plantarum (1753) de Linneo, axuntaba la información global hasta les especies y variedaes nos conceutos taxonómicos del autor (los ecotipos y fenotipos derivaos d'ellos); na actualidá la flora global editada por Kubitzki foi empecipiada en 1990 ya inda nun ta terminada, los volumes siguen publicándose esporádicamente 25 años dempués, y llega hasta'l rangu de xéneru. Les flores y faunes son esfuerzos conxuntos nos qu'un taxónomo editor da-y a cada taxónomo o pequenu grupu d'ellos a describir exhaustivamente el taxón pal que ye especialista na rexón dada, polo xeneral hasta la categoría d'especie, convenientemente revisáu, chequeado coles colecciones esistentes y la bibliografía previa convenientemente revisionada; polo xeneral estos proyectos tarden décades en completase y pueden quedar incompletos si los subsidios polo xeneral gubernamentales dexen d'anovase. Un problema que tienen d'enfrentar los usuarios d'estes claves ye la so antigüedá, pola que munches vegaes tán desactualizadas. Los nomes recién descriptos pa la ciencia pueden nun atopase nelles, como les nueves revisiones de xéneros y families con especies exótiques que s'instalaren apocayá na rexón. Otru problema ye que dos flores o faunes qu'afecten la mesma área (como una flora o fauna local y una rexonal) pueden diferir nos sos conceutos de taxón o nes sos circunscripciones y polo tanto dar resultancies distintes. Les claves computarizadas tienen munchos de los mesmos problemes que les claves en papel, anque ye esperable que nel futuru ufierten meyores facilidaes pa ser actualizaes y pa la busca rápida de sinónimos.[204] Les actualizaciones atopar nes monografíes (monographs), un estudiu estensu con claves, descripciones y semeyes d'un taxón en particular polo xeneral nel rangu de familia o xéneru, y nes revisiones taxonómiques (taxonomic revisions), similares a les monografíes pero menos refeches.[18] Los dos últimes publicar en revistes científiques ([18]:560), y pueden ser aportaes, como les flores y faunes, nes biblioteques de los xardinos botánicos, museos y universidaes que les sos biblioteques y hemerotecas tengan accesu al públicu. Les empones de campu (field guides), qu'inda son más fáciles d'aportar y tienen munches fotografíes ya ilustraciones de les especies d'un taxón nuna rexón particular, volviéronse bien populares y son útiles como un primer aproximamientu a conocer la flora o la fauna d'una rexón dada, siempres que s'utilicen con precuru y teniendo en cuenta que namá describen les especies más vistoses y non siempres pueden faer usu de les ferramientes qu'estremen un grupu d'especies similares.[205][186][171]

Al utilizar una clave, siempres hai que lleer curioso los dos opciones, tener en cuenta toes los calteres mentaos, nun envalorar les midíes sinón realizales, buscar nel glosariu tolos términos que nun se conozan, y tener en cuenta que los seres vivos tienen cierta variabilidá, asina que si esiste la posibilidá de ver un calter delles vegaes (por casu en delles fueyes d'una planta) va ganar en precisión. ([18]:558) Munches vegaes nun rescampla qu'una descripción corresponder col especímen, porque non necesariamente tolos calteres d'una descripción van corresponder con tolos calteres del especímen. Al utilizar una clave ye bien probable qu'en dalgún momentu llegar a un par de descripciones onde'l camín a siguir sía confusu. Cuando ye asina, hai que siguir los dos caminos, si dalgunu de los dos ye bien incoerente (por casu si pide la observación de dellos calteres que nun esisten nel espécime) refúgase. Si non pueden refugase caminos, va llegar a más d'un posible taxón ([171],[18]:558,[20]:496-497). Anque se llogre una sola resultancia, ye importante chequearlo. Una forma de faelo ye lleer la descripción y ver les ilustraciones del taxón o los taxones a los que se llegó, especialmente evaluando la llista de les sos calteres diagnósticos, que ye una llista de tolos estaos de calteres del taxón que lo estremen de los demás taxones. Si coinciden colos calteres del espécime, entós realizóse la identificación ([18]:558,[20]:495). Otres formes de faelo son la comparanza con dalguna colección de especímenes, con colecciones de semeyes, o en especímenes dificultosos onde entá queden duldes, unviá-ylo a un especialista meyor entrenáu nesi taxón ([20]:497).

Vease tamién: Siguir lleendo en Identificación de especímenes

Hestoria de la taxonomía[editar | editar la fonte]

Los oríxenes de la taxonomía remontar a los oríxenes del llinguaxe, cuando les persones llamaben colos mesmos nomes a los organismos más o menos similares, sistema que persiste anguaño no que llamamos los "nomes vulgares" de los organismos. Toles sociedaes humanes tienen un sistema taxonómicu que noma a les especies y arrexuntar en categoríes d'orde cimeru. El ser humanu tien un conceutu intuitivu de lo que constitúi una especie, productu d'arrexuntar a los organismos según les propiedaes emerxentes reparaes a esi nivel d'organización, y esto vese reflexáu en que toles clasificaciones populares de los organismos tienen remarcables semeyances ente elles y tamién coles utilizaes anguaño polos biólogos profesionales[206].

La taxonomía biolóxica como la disciplina científica que conocemos anguaño nació n'Europa. Ellí, a fines de la Edá Media formáronse les primeres universidáye, onde s'aldericaben temes de índole filosófica y técnica. Llueu los naturalistas diéronse cuenta de que, magar los nomes vulgares son útiles pa la fala cotidiana, precisaben un sistema más universal y rigorosu pa nomar a los organismos: cada especie tenía de ser nomada, cada especie tenía de tener un únicu nome, y cada especie tenía de ser descripta de forma inambigua. Al rematar la Edá Media, cola dominación militar y cultural qu'una Europa revitalizada sostendría sobre'l restu del mundu, el sistema ellí consensuáu estender a tol globu.

De la taxonomía linneana al orixe de los Códigos[editar | editar la fonte]

Portada de la obra de Linneo Species Plantarum (1753[207]), la primera Flora de la taxonomía moderna. Dos años antes publicara'l landmark teóricu nel qu'esplicaba los principios colos que construyó esta Flora, Philosophia Botanica (1751[142]). Los dos obres fueron publicaes en llatín, l'idioma universal de la dómina.

Yá en 1583, l'italianu Andreas Caesalpinus había delineado cuálos teníen de ser les característiques d'un sistema de clasificación: tenía de ser bono d'usar y de memorizar, estable nel tiempu, concisu, y amás predictivu (ver Greene 1983[208] citáu en Judd et al. 2007[18]). Polo tanto esistía la conciencia de qu'un sistema de clasificación non yá tenía de reflexar la naturaleza (ser predictivu), sinón tamién sirvi-y d'utilidá a una comunidá d'usuarios.


Por un tiempu los naturalistes fixeron tibios intentos d'ordenar la información disponible sobre los organismos y reglamentar los sos nomes. Pero ensin dala dulda foi nel sieglu XVIII que la taxonomía recibió un emburrión definitivu gracies al naturalista suecu Carlos Linneo, quien tenía l'ambición de nomar tolos animales, plantes y minerales, arrexuntalos según les sos semeyances, y normalizar la so denominación. Magar yá publicara trabayos más modestos antes, foi en 1753 cuando publicó una xigantesca Flora de dos volumes nel qu'almacenó y ordenó tola información disponible sobre les plantes, incluyendo les sinonimies colos demás autores, y por cuenta de el so ésitu, terminó siendo'l trabayu que definió'l sistema de clasificación que s'utiliza anguaño. El llibru llamábase Species Plantarum ("Les especies de plantes", "Los tipos de plantes"), y taba escritu en llatín, l'idioma universal de la dómina. Nesta Flora Linneo arrexuntó les sos "especies de plantes" nuna categoría d'orde cimeru llamada xéneru, qu'él llamaba xéneros "naturales", nos qu'arrexuntaba les especies según les sos semeyances morfolóxiques. Al describir una especie dientro de cada xéneru, namá debía listar los calteres de la mesma que la estremaben de les demás especies del so mesmu xéneru. D'esta manera, al enfatizar l'usu de semeyances morfolóxiques p'arrexuntar a los organismos, Linneo taba clasificando a los organismos en virtú de les sos semeyances xenétiques, y polo tanto tamién evolutives. Nel so llibru, cada especie yera descripta con una frase en llatín llindada a 12 palabres, onde la primera siempres yera'l xéneru al que pertenecía la especie. A estes pequenes descripciones, o polinomios, él llamar "el nome apropiáu de cada especie", pero fixo un importante amestáu que fuera inventáu nel so momentu por Caspar Bauhin (1560-1624): la nomenclatura binominal o binomios, como'l "nome curtiu" de les especies. Nos marxes del llibru, siguíu del nome "apropiáu" polinomial de cada especie, escribió una sola palabra. Esta palabra, combinada cola primer palabra del polinomiu (inda güei llamada xéneru), formaba un nome más fácil de recordar y curtiu pa cada especie. Por casu, la yerba de gatu foi nomada "apropiadamente" col polinomiu: Nepeta floribus interrupte spicatus pedunculatis (n'español, "Nepeta con flores nuna espiga atayada pedunculada"). Linneo escribió la palabra cataria nel marxe del nome apropiáu de la especie, que quier dicir "rellacionada colos gatos", faciendo referencia a un atributu familiar de la especie. Tanto él como los sos discípulos adoptaron el nome Nepeta cataria pa esa planta, y rápido los sos contemporaneos empezaron a llamar a les especies del llibru col so nome binomial.

Linneo publicó Philosophia Botanica[142] dos años primero que la Flora global na qu'introduciría la nomenclatura binomial de cada especie, Species Plantarum. En Philosophia Botanica compara la so nomenclatura con otres n'usu nesi momentu, ya introduz los conceutos taxonómicos que va acomuñar a les categoríes de xéneru, especie y variedá. La mayoría de los xéneros son heredaos d'autores anteriores eminentes en cada taxón, convenientemente citaos de primeres del llibru xuntu coles sos obres y les biblioteques onde podíen ser lleíos, y la nomenclatura utilizada pa esa categoría ye munches vegaes el nome del xéneru tal como lu utilizó l'autoridá preferida por Linneo pa esi xéneru —si ye necesariu latinizado o simplificáu—, siguíu del autor del conceutu taxonómicu (que non necesariamente yera l'autor de la primer descripción). Munchos nomes de xéneru fueron utilizaos yá n'obres de l'antigua Grecia y yá se perdiera l'autor orixinal, la descripción orixinal o la etimoloxía del nome. Nes últimes décades el xéneru como rangu tuviera tomando forma, ello ye que en 1694 Joseph Pitton de Tournefort aprovió guíes pa describir grupos "naturales" de plantes na categoría de xéneru: los calteres teníen de ser reconocibles en tolos miembros del xéneru y ser visibles a güeyu, ensin necesidá d'un microscopiu. No posible, estos calteres teníen de ser tomaos de la flor y el frutu, que yeren menos lábiles que los rellacionaos col vezu. Linneo creía que los grupos qu'él allugaba nes categoríes d'especie y xéneru, y delles families (grupos de xéneros), esistíen na naturaleza, yeren "grupos naturales", ente que les categoríes más altes namá fueron utilizaes por él por conveniencia humana. Esta distinción ente un conceutu taxonómicu "natural" y unu "artificial" nun yera menor, una y bones el creer que los xéneros fueren reales (esto ye, qu'esisten independientemente del nuesu discernimiento), guía al investigador d'una forma distinta de la que lo fai una categoría artificial. En palabres de Linneo:


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Los calteres nun faen al xéneru, el xéneru danos los sos calteres.

— Carlos Linneo (1751[142]:119)Cquote2.svg


Con estes palabres, Linneo reconocía que les especies arrexuntar de forma distinta si escoyíen calteres distintes pa estremales, pero había "daqué más" que la mera semeyanza de calteres qu'arrexuntara a les especies nun mesmu xéneru, y había que saber escoyer los calteres a considerar por que la agrupación resultara correspondese con un "grupu natural". Esta afirmación, frutu de la intuición de Linneo, nun taría acomuñada a un mecanismu hasta que Darwin pudo publicar la so teoría de la evolución en 1859.

Linneo falló n'atopar calteres que fueren comunes a tolos miembros d'una familia, entá nes más "naturales" d'elles, como les umbelíferes.
Na semeya: fueyes d'apiu (Apium) coles sos pequenes inflorescencies, vezu de la cenahoria (Daucus), inflorescencies de fenoyu (Foeniculum), inflorescencies del cardu corredor (Eryngium), raigañu de perexil (Petroselinum).

Linneo arrexuntó a los xéneros naturales n'ordes y clases artificiales, utilizaos cual clave d'identificación, útiles por que los xéneros sían fáciles d'atopar nuna llista o un herbario. Los calteres qu'utilizó pa ello fueron el númberu de estambres y el númberu de estigmes de los carpelos, que yeren estables dientro de cada xéneru y fáciles de cuntar. Por casu na clase Pentandria, orde Pentandria Digyna, allugó a los xéneros que les sos flores allugaben 5 "homes" y 2 "esposes", quedando arrexuntaes nel mesmu orde les umbelíferes como Daucus (la cenahoria), y la ulmácea Ulmus (la llamera); a les criptógames, como nun tienen flores, arrexuntar ente les "plantes de nupcias clandestines".

Linneo tamién trató de reconocer delles families "naturales", una categoría entemedia ente'l xéneru natural y l'orde artificial de Linneo (la idea de que dellos grupos naturales podíen ser acomuñaos a la categoría de familia tamién yera anterior y data de Pierre Magnol en 1689[209]), magar falló n'atopar calteres únicos que pudieren funcionar como diagnósticos de les mesmes, y para 1751 yá reconociera 67 families (Linneo 1751[142]), dexando munchos xéneros ensin allugamientu. Linneo buscaba calteres que fueren atopaos en tolos miembros de cada familia, pero la so busca falló entá nes más "naturales" d'elles, como les umbelíferes.

L'ésitu del llibru de Linneo debíase non yá a la claridá de les sos descripciones y clasificación sinón tamién a que se convirtiera na revisión más refecha de la lliteratura taxonómica hasta'l momentu, con una notación cuidadosa de sinónimos. D'esta forma considerar un "pasaxe en llimpiu" y nuevu puntu de partida de la lliteratura taxonómica, arreglando asina los problemes de comunicación producíos pola variedá de nomes y sistemes de clasificación locales. A partir d'esi momentu les actualizaciones de la clasificación feches pol mesmu Linneo o por autores posteriores, intentaron nun abandonar la nomenclatura binomial nin el sistema de clasificación impuestos por Species Plantarum.

Ficheru:Species Plantarum primer páxina.png
Primer páxina de les especies en Species Plantarum (fragmentu).

En 1758 llegaría-y el vez a los animales cuando Linneo publica la décima edición de la so Systema Naturae, nel que per primer vegada clasificar como fixera en 1753 coles plantes, adoptando la nomenclatura binominal. Linneo nomó unes 4.400 especies d'animales, incluyendo Homo sapiens, lo que demuestra que la dómina yá nun tenía reticencies en clasificar al home colos animales[nota 15]. El so conceutu taxonómicu d'especie, les sos "tipos", yeren los que güei llamamos ecotipos,[142] polo que toa una comunidá reproductiva (lo que darréu se llamaría "la especie biolóxica") yera estremada por él n'especies del xéneru colos sos respectivos nomes binomiales.

Les esceiciones fueron siendo amestaes al sistema de clasificación, delles especies yeren clasificaes nun orde distintu que'l restu del xéneru. Dende l'apaición de los llibros de Linneo a dellos autores, como a Michel Adanson (1763-1764[209]), fíxose-yos evidente que tolos calteres podíen variar y que nun hai calteres "esenciales" pa definir a un "grupu natural", que teníen de ser definíos namá por aciu un conxuntu de calteres tomaos de too l'organismu, de los cualos la mayoría, pero non necesariamente toos, taríen en cada organismu de la especie, en cada especie del xéneru, en cada xéneru de la familia. Asina s'abandonaba'l conceutu de taxón monotético[cita 63][cita 28] de la que s'empezar a entrar nuna era de taxonomía cuantitativa, o politética, con numberosos calteres combinaos nun diagnósticu[cita 64][cita 27][cita 28].

En 1778 Lamarck suxurió que los calteres utilizaos polos científicos pa estremar los taxones non necesariamente teníen que ser los mesmos que la xente utilizara pa identificar dalgún organismu atopáu. Lamarck promovio dixebrar la clasificación de les claves d'identificación, clasificaciones artificiales unitéticas nes que los usuarios non espertos podíen llegar al taxón natural d'un organismu dáu por aciu calteres que tuvieren al so algame y con riegles de decisión esplícites. D'esta forma apangóse'l conflictu ente'l ceadores de los sistemes de clasificación, qu'a midida que aumentaba la información disponible creaben clasificaciones cada vez más críptiques, y los usuarios d'esos sistemes, que taben más comenenciudos na utilidá del sistema que na "naturalidá" de los sos grupos. En 1789 l'esitosu tratamientu taxonómicu de Antoine-Laurent de Jussieu, Xenera plantarum[212], allugaba per primer vegada por un autor reconocíu tolos taxones penriba de xéneru en conceutos taxonómicos "naturales", empecipiando la nomenclatura de les families de plantes.

El términu "Taxonomía" foi propuestu por Augustin Pyrame de Candolle en 1813[213] a partir del griegu ταξις (taxis, arreglu o clasificación) y νόμος (nomos, llei), pa referir a la ciencia de la clasificación de los organismos.[18] El términu "Sistemática" yá s'utilizara notablemente por Linneo (p.ej. en Systema Naturae 1735) y provien del términu griegu latinizado systema.[214] Nun sería hasta 1940 en que'l términu "la Nueva Sistemática" ("the New Systematics", Huxley 1940[215] citáu en Mayr et al. 1953) estremaría'l focu d'atención d'estos taxónomos de los que siguíen realizando una taxonomía atribuyida a la escuela de Linneo d'estremar "tipos" y aldericar la nomenclatura, a los que siguíen llamando "taxónomos" o "la Vieya Sistemática" (the Old Systematics).[214]

Linneo definiera metodológicamente el conceutu taxonómicu de variedá, al que-y dio nome trinomial (con un epítetu subespecífico siguiendo al de la especie), como'l conxuntu de plantes tomaes del ambiente orixinal de la especie que yera criáu en condiciones distintes, llogrando dempués d'una o poques xeneraciones distintes fenotipos a partir del xenotipu orixinal:[142]

Les variedaes son plantes de la mesma especie, modificaes por dalguna causa adventicia o d'otru tipu.

L'usu de les variedaes en xardinería, cocina y medicina fai necesariu reconoceles na vida ordinaria; d'otra manera, les variedaes nun concernen a los botánicos, sacante en relación a la tema que los esmolez, que les numberoses especies [si nome binomial, los ecotipos criaos nel so ambiente, Linneo 1751[142]:af315] nun tendríen de tener multiplicidá de nomes o ser confundíes.
Cuando ye necesariu, el botánicu tendría d'amestar los nomes de les variedaes más significatives a la fin de la definición [de la especie], pal beneficiu del públicu.
[...] El suelu camuda les plantes, y como resultáu les variedaes son producíes; y cuando el suelu ye camudáu éstes reviértense.


Linneo (1751[142]), af. 306, 316.


Nes especies lineanas, el xenotipu ye invariable, y atópase en caúna de les sos variedaes.

Un ciertu númberu de sistemáticos, especialmente en Francia y Alemaña, adoptó'l conceutu de "espécime tipu". Estos "especímenes tipu" yeren plantes depositaes nun yerbariu que representaben la forma más común del taxón, o dacuando la forma que l'autor consideraba la más "perfecta", de la que'l restu del taxón seríen plantes degradaes (hibridaes con otros tipos o mutantes).[18]

La falta d'estabilidá nomenclatural nes publicaciones taxonómiques nes décades siguientes a les obres de Linneo fixo apeligrar el so llogru. Eso llevó al alderique y la formación de distintos Códigos de Nomenclatura, que nun yeren adoptaos por un númberu significativu de taxónomos. Dos d'ellos en particular fueron, en 1813, Théorie Elémentaire de la Botanique ("Teoría Elemental de la Botánica") onde se reglamentaba la elección del nome válidu pa cada taxón de plantes; y en 1842, sol auspicio de la British Association for the Advancement of Science ("Asociación Británica pa la Meyora de la Ciencia"), el Strickland Code (el "Códigu de Strickland", Strickland et al. 1842[216]). Éstos seríen los que, daqué modificaos, unes décades más tarde consensuaríense como Internacionales. (Falten los cambeos en relación a Philosophia Botanica de Lineo)

D'esta forma, dende Linneo hasta los Códigos, nacieron les riegles de nomenclatura zoolóxica y botánica.

Taxonomía y evolución[editar | editar la fonte]

Darwin evitó escrupulosamente proponer árboles filogenéticos pa organismos reales, pa evitar el ridículu que-y quitara méritu a la so misión: demostrar la evolución como fechu, amosando cómo la llucha pola esistencia esplica l'adaptación, y tratando d'esplicar el cambéu evolutivu (tresformamientu) por variación xenética y la multiplicación diferencial de xenotipos. Al enfatizar cómo l'ascendencia común más la diverxencia de fenotipos esplica'l patrones de semeyances y diferencies que nos dexen clasificar organismos en taxones sucesivamente añeraos dientro de taxones cimeros, Darwin astutamente utilizó un árbol astractu inmune al ridículu o al erru filogenético. Él correchamente acotó que'l plan corporal compartíu por miembros d'un filu taba presente nel so ancestru común más recién, y que foi heredáu de forma estable xeneración tres xeneración, ensin cambeos fundamentales per cientos de millones d'años. Baxando nes categoríes al traviés de clases, ordes, families, xéneros y especies, cada grupu subordináu socesivu difería de los sos relativos más cercanos en calteres d'estabilidá decreciente. ([40]:112)

Darwin en 1859 nun foi'l primera proponente, pero nunca antes la evolución como fechu tuviera tal penetración nel ambiente científico. Cuando aprució a mediaos del sieglu XIX la so teoría de la evolución llueu s'almitió, tal como formuló'l mesmu Darwin en L'orixe de les especies, que'l grau de semeyanza morfolóxica ente les especies yera esplicáu pola esistencia d'un árbol filogenético que les conectaba por parentescu. Les circunscripciones lineanas asumíen que nos conceutos taxonómicos "naturales" de xéneru y especie nun esistíen les variaciones naturales de los calteres "esenciales" (qu'estremaben la especie de les demás dientro d'un mesmu xéneru, y un xéneru de los demás dientro de la mesma familia, y qu'ufiertaben diferetes nichos pa cada taxón), lo qu'entraba en conflictu colos grupos llograos nes coleutes. El conflictu ente teoría y colecciones resolveríase cuando s'interpretaría que nun hai calteres "esenciales" nuna clasificación natural porque toos, incluyíos los que representaben novedaes evolutives que dieren entamu a grupos nuevos, tienen el potencial d'evolucionar dientro d'un grupu.

El sistema lineano de clasificación ta formáu por grupos añeraos y non asolapaos, y un árbol filogenético tamién puede reconstruyise con métodos qu'arreyen técniques d'agrupamientu xerárquiques, non asolapaes;[2] polo qu'un sistema de clasificación lineano "natural" en principiu sería, tal como afirmaba'l mesmu Darwin, congruente cola filoxenia de les especies: les relaciones ente taxones nes taxonomíes naturales fueron reinterpretadas como la resultancia de la evolución, y les categoríes taxonómiques como indicadores de la estabilidá evolutiva de los calteres que los definen. Ensin afayar inda la estructura del ADN, portador del códigu xenéticu, qu'asocedería recién nos '1960 con Watson y Crick, atropábense les pruebes del heriedu de los calteres probablemente agospiaos nos cromosomes, pa les que los redescubiertos radios de Mendel fueron pioneros, que derivaríen na "Nueva Síntesis" a principios del sieglu XX. En plena puxanza de la Nueva Síntesis, Ernst Mayr propunxo afitar unu de los conceutos d'especie qu'hasta esi momentu fueren llamaos la especie biolóxica —la propuesta por Mayr, pa otru autores más neutralmente llamaríase la especie reproductiva— como'l grupu de poblaciones capaz d'hibridar ente sigo y dar descendencia fértil, que'l so pool o mancomún xenéticu caltiense aislláu de los d'otres en simpatría. Y Mayr suel ser citáu como un taxónomo que definió'l conceutu d'especie que más fácilmente les delimitaba en vertebraos de tamañu grande —a los que pertenecíen los taxones nos que trabayaba—, con una precisión que nesos taxones correspuéndese meyor colos demás conceutos qu'en plantes y microbios.[18] George Gaylord Simpson (1961[15]), descontentu cola atemporalidad del conceutu d'especie biolóxica de Y Mayr, redefinió a la especie como un llinaxe, una secuencia d'ancestros y descendientes col potencial d'afitar un cambéu evolutivu nun calter (lo que Hennig[37] llamaría una apomorfía), quiciabes el mesmu modelu que Linneo deducía nos sos postreros escritos pa les especies dientro de los sos xéneros y families "naturales". Si les especies defínense como poblaciones, o como llinaxes, non siempres dos organismos de dos especies distintos van estremar en términos de los sos calteres —por casu, dos poblaciones inda bien similares en distintos continentes, que'l so índiz de dispersión nun-yos dexó atopar se por un tiempu enllargáu, inda van tener siquier potencialmente organismos que nun puedan estremase ente sigo taxonómicamente más que pola localidá de la que provienen—. Hennig (1950[36] n'alemán, 1966[37] n'inglés) atopar col mesmu problema. Asumió que los llinaxes, que para él tamién se correspondíen con especies, podíen estremase taxonómicamente en términos de los sos apomorfías adquiríes, polo que nun habría conflictu ente la taxonomía y l'árbol de llinaxes. Linneo (1751[142]) incluyera la localidá de la que proveníen los organismos nos sos conceutos d'especie, y tamién el fenotipu col que s'atopaben n'estáu montés (son los güei llamaos ecotipos), siendo la variedá un fenotipu distintu criáu en distintes condiciones. La localidá y el fenotipu nun volveríen ser incorporaos a les clasificaciones.

La incorporación del conceutu d'evolución a los taxones supraespecíficos foi de primeres modelada de forma errática. Por casu, delles clasificaciones componer de taxones basaos en filoxenies qu'inda conteníen miembros vivientes, como los árboles de Charres Edwin Bessey (1845-1915) y los de Arthur Cronquist (1919-1992). Nestos árboles nun había ancestros extintos ([18]:43). Na clasificación de Rolf Dahlgren, los ancestros yeren namá miembros extintos, l'árbol filogenético yera un árbol tridimensional, y los miembros vivientes podíen representase por un corte d'un planu d'esi árbol, nuna diagrama llamáu "Dahlgrenograma" con relaciones similares a les de los países nun mapa. Un pasu críticu foi l'alquisición de los métodos de reconstrucción filogenética atribuyíos a la escuela que güei llamamos cladismo, pa la cual el biólogu Willi Hennig foi'l que fixo'l más pervalible apurra na década de 1960. Hennig modeló que les especies conectar ente elles al traviés d'especies ancestrales –nel so modelu orixinal siempres extintas–, y que podía rastrexase'l tresformamientu d'especies ancestrales a especies derivaes al traviés de les apomorfías xeneraes mientres una cladogénesis: los cambeos de calter en cada llínea depués de la diverxencia d'un llinaxe en dos. Estos árboles, güei llamaos cladogramas, fueron propuestos por Hennig como material pa construyir los taxones, que siempres teníen de ser, al so criteriu, monofiléticus. Estos cladogramas teníen el non trivial supuestu de que la hestoria evolutiva d'un grupu siempres asocede por procesos de cladogénesis (diverxencia en dos y alquisición de apomorfías). Na mesma década la escuela fenética, pa la que'l llibru de RR Sokal y PHA Sneath (1963[47]) foi fundacional, creaba métodos numbéricos d'analises de datos intentando que fueren "ciegos", ensin hipótesis d'evolución previes (ensin hipótesis previes de cuálos seríen les apomorfías y les plesiomorfías). Pola dómina en que Hennig popularizábase y en respuesta al cladismo la escuela tradicional, qu'incorporó los métodos de construcción de dendrogramas Hennigianos y los métodos numbéricos na busca del árbol filogenético, pero difería en cuál ye'l dendrograma que tien de treslladase a una clasificación, foi llamada evolucionismu, la escuela evolucionista propón, como d'antiguo, que puede haber grupos parafiléticos "naturales" que tienen de formar parte d'una clasificación formal. El primeru n'utilizar el términu "cladismo" en reemplazu del confusu términu Hennigiano "sistemática filogenética" foi Y Mayr (1965[39]), pero yá s'utilizaba "clado" nun sentíu más ampliu, como hipótesis de ser tolos derivaos d'una secuencia d'ancestros y descendientes con un ancestru común, ye dicir una hipótesis de grupu monofiléticu. Hennig tamién redefinió monofiléticu, qu'hasta esi momentu asumíase incluyendo los grupos monofiléticus y parafiléticos sensu Hennig.[40]

Escontra fines de la década de 1970, cladistas como G Nelson[5], NIN Platnick[5] y C Patterson[6] evolucionaron el pensamientu cladista escontra un "cladismo de patrones" o pattern-cladism o transformed cladistics, que dixebraba teóricamente los árboles filogenéticos, ye dicir los árboles de secuencies d'organismos ancestros y descendientes, de los árboles de apomorfías, que pueden correspondese o non llinaxe per llinaxe col árbol d'organismos.[cita 2]

Cquote1.svg Como Hull (1979[3]) yá fixo notar, los cladistas en realidá clasifiquen calteres en llugar d'organismos, tienen que faer el camientu arbitrariu de que nueves apomorfías aníciense cada vez qu'una llínea [filética] ramificar de la so llínea hermana. Esto ye pocu probable na mayoría de los casos.
Y Mayr (1981[4]) citando la nota 28.Cquote2.svg

Cquote1.svg Les clasificaciones cladistas nun representen l'orde de ramificación de grupos hermanos, sinón l'orde d'emerxencia de calteres derivaos únicos.
DL Hull (1979[3]) como citáu en Y Mayr (1981[4]) nota 28.Cquote2.svg

Cquote1.svg Nós utilizamos el cladograma nel sentíu d'un sumariu xerárquicu de los datos de calteres, nun contien necesariamente supuestos sobre, nin fai predicciones de, evolución y especiación.
—Nelson y Platnick (1981[5]:14).Cquote2.svg

Cquote1.svg Los sistemáticos siempres fueron, son, van ser, y tendríen de ser tipologistas.
—Nelson y Platnick (1981[5]:328)Cquote2.svg

Anguaño la sistemática nos sos analises amiesta una cantidá de calteres en delles llínees d'evidencia distintes, llínees que pueden considerase abondo independientes ente sigo: desenvolviéronse métodos de analís del ADN, métodos bioquímicos (isozimas, flavonoides...), amestáronse los calteres de ultraestructura y micromorfología tomaos colos microscopios electrónicos de tresmisión y de barríu, y fixéronse meyores en paleontoloxía. Estes matrices con una cantidá enorme de datos pueden analizase colos métodos d'analises filogenético pa los que la escuela fenética foi pionera, y aprovechando l'usu d'ordenadores, que producieron na década del 90 y la del 2000 taxones nunca antes tan consensuaos y munchos d'ellos hasta inesperaos, lo cual obligó a modificar les clasificaciones al usu, desfaciendo grupos de llarga tradición pa definir otros nuevos.

Na actualidá los sistemes de clasificación publicar en collaboración d'una llarga llista d'autores: pa les angiospermas el grupu que se llamó APG (1998, 2003, 2009[217]), pa los taxones cimeros Adl et al. (2005[90]), etc. L'alderique qu'inda perdura ente taxónomos ye si tienen d'aceptase grupos parafiléticos o non nes clasificaciones. Los grupos parafiléticos y monofiléticus tán compartiendo'l mesmu "tipu" nos Códigos, lo cual lleva anguaño a una gran inestabilidá na nomenclatura.

Formalización de les normes: los Códigos[editar | editar la fonte]

El que originalmente fuera Théorie Elémentaire de la Botanique en 1813 foi reemplazáu en 1930 pol altamente consensuáu, "internacional", International Code of Botanical Nomenclature (Códigu Internacional de Nomenclatura Botánica, ICBN), que trata sobre la nomenclatura de plantas y hongos. El que originalmente fuera'l Strickland Code (1842), que reglaba los nomes de los animalye, foi revisáu y renombráu como International Code of Zoological Nomenclature (Códigu Internacional de Nomenclatura Zoolóxica, ICZN) en 1901. El principiu básicu de los dos Códigos yera'l principiu de prioridá, que promovería'l so oxetivu básicu, el so principiu más[218] básicu: la estabilidá na nomenclatura. El de Botánica estableció l'añu de la publicación de Species Plantarum, 1753, como l'añu en que s'empecipia la nomenclatura botánica moderna, dexando ensin efectu los nomes publicaos pa llantar antes d'esa fecha. De la mesma forma, el Códigu de Zooloxía estableció l'añu 1758, l'añu en que Linneo publicó la décima edición del Systema Naturae y el primeru en qu'utilizó la so nomenclatura binomial pa los animales, como'l d'entamu de la nomenclatura zoolóxica, dexando ensin efectu los nomes publicaos p'animales antes d'esa fecha. Los dos Códigos compartieron los mesmos "principios de Nomenclatura", y dende la so apaición realizáronse dacuando Congresos Internacionales pa la so revisión.

Los bacteriólogos, que s'atuvieren al Códigu Botánicu, col tiempu desenvolvieron el so propiu Códigu (Códigu Internacional de Nomenclatura de Bacteries, publicáu en 1958). El Códigu Internacional de Plantes Cultivaes de la mesma biforcó los cultivares de les variedaes botániques en 1952, cola so última publicación en 2009.[219]

A lo llargo del tiempu fueron constantes les propuestes d'harmonizar, unificar, o reemplazar los Códigos, pero nenguna llograría un altu consensu (Dall 1877,[220] ver tamién Savory 1962[221]).

(tipo - definición d'estabilidá)

Relación coles taxonomíes populares[editar | editar la fonte]

Sabemos bien pocu alrodiu de la relación ente los naturalistes profesionales y los aficionaos y el públicu polo xeneral, magar estes relaciones formen parte de la fonderada histórica qu'ayudó a modelar la bioloxía sistemática (Judd et al. 2007, pero ver por casu Allen 1976[222]).

Como la sistemática tuvo'l so orixe n'Europa, los primeros grupos que se formaron fueron aquellos que yeren obvios na flora europea. Amás, la disciplina tuvo apoderada por europeos mientres centuries. Fora d'Europa, especialmente naquellos llugares que fueren colonies europees, la dominación europea foi especialmente evidente en que les flores de los países fueron escrites por botánicos europeos y basaes en materiales guardaos n'instituciones europees (Judd et al. 2007:41). Fora d'Europa, los científicos munches vegaes desvalorizaron les conocencies que teníen sobre les especies los nativos que teníen una fonda conocencia de la Naturaleza nel llugar del que yeren orixinarios. Por casu, cuando los europeos afayaron América y rellacionáronse colos sos pueblos orixinarios, desoyeron esa pervalible fonte de conocencia.


Poques vegaes les conocencies locales fueron utilizaos tantu con criterios antropolóxicos como pa la investigación farmacéutica. L'adecuación o non de les taxonomíes tradicionales al criteriu científicu foi oxetu de delles investigaciones. [nota 16]

Perspectives actuales de la ciencia de la Taxonomía[editar | editar la fonte]

Nes décades de 1990 y 2000 volvió ponese de moda la ciencia taxonómica nel ambiente científico,[141][24][225][226] debíu en parte al revolucionariu enfoque facer# posible pola cantidá de datos derivaos del analís de ADN a los problemes taxonómicos,[141] y en parte a la conciencia de la so utilidá, dada la crisis de biodiversidá que tamos viviendo. Nueves tecnoloxíes rellacionaes cola digitalización de los datos y l'usu d'internet ufierten un potencial ensin precedentes pa la diseminación de los productos de la investigación, pero coles mesmes qu'éstes remanecen reparar "brengosos intentos" escontra'l encapsulamiento y l'establecimientu de nueves barreres pa la comunicación.[227] Les nueves ferramientes disponibles xeneren un alderique alrodiu de la utilidá de les riegles de la nomenclatura nel so estáu actual, y plantegen la necesidá de reformar los Códigos, reformes qu'entá se tán aldericando y dalgunes d'elles yá s'incorporaron.[154]

La torga taxonómica[editar | editar la fonte]

Ficheru:Wheeler 2004 Fig 1 númberu propuestes evaluaes pola US NSF en Bioloxía Sistemática.png
Nel períodu nos '1990 en que foi "tecnológicamente correctu"[24] realizar analises moleculares d'ADN presupuestar a la Bioloxía Sistemática, pero la descripción de la biodiversidá -de la que'l mayor apurra sigui proviniendo del númberu de puestos de trabayu estables esvalixaos balanceadamente en toles rexones n'universidaes, museos y xardinos botánicos-[23], quedó apostrada. ([24],[228] citáu en[23])

Quiciabes sosprienda que la descripción de les especies güei calcúlase realizada namá nun 1% o hasta un 15%, porque les plantes y los animales grandes de rexones bien poblaes como les rexones templaes tán relativamente bien descriptos, pero fora d'elles, como nos estratos arbóreos más altos de les selves tropicales o nel mundu microbianu colos sos tiempos xeneracionales tan pequenos que lo vuelven vastu y facer evolucionar a una velocidá enforma mayor que les plantes y animales de los qu'acostumamos a venos arrodiaos, les descripciones tienen anguaño un resolvimientu bien baxu. Como munchu autores recuérdennos, les descripciones d'especies "nunca tán completes",[229][24][103][230] una y bones los descubrimientos de nuevos calteres y nueves poblaciones que trai cada nueva llínea d'evidencia y cada nueva coleuta obliguen a retestear les hipótesis y chequear cómo evolucionaron los llinaxes y cómo s'esvalixaron dende la última coleuta. Les demás ciencies de la vida (life sciences) vense llindaes cuando les hipótesis taxonómiques de les que faen usu son pocu resueltes o confiables,[179][24][231][232], lo que vuelve los oxetivos d'esta ciencia anguaño bien alloñaos de la demanda[233], a lo que se refier dende[234] la Convention on Biological Diversity de 1995 como "la torga taxonómica".[229][233] Les causes de la torga fueron llamaes polos científicos "la crisis taxonómica"[229][102], o tamién "la torga a la taxonomía"[233], en referencia a la relativa[233] falta de recursos treslladaos a alfa-taxonomía y a les torgues sociales[235][236] pal so desenvolvimientu, una ciencia que tien de competir polos recursos llindaos n'universidaes y subsidios coles mesmes ciencies que la tienen de torga.[179][230]

Los taxónomos descriptivos tienen pocos gastos amás del salariu, los que precisen pa publicar, pa realizar dalgún viaxe y quiciabes dalgún equipamientu adicional, de lo que lo más oneroso ye'l "molecular lab" del que basta con unu cada 10 llaboratorios.[23] A lo que los taxónomos referir por recursos n'alfa-taxonomía ye presupuestar más cantidá de taxónomos con subsidios, plazos y evaluaciones curriculares más realistes, y el caltenimientu al llargu plazu de les colecciones:[237]

  • (1) Les colecciones[238][230][237] a les que güei se suman les d'arquivos dixitales y les de cultivos vivos de bacteries, protozóos, algues y hongos[239], que se suxure que se depositen n'instituciones dedicaes como muséus y xardinos botánicos. Dalgunos d'ellos tienen colecciones yá centenaries que caltienen los exemplares de la distribución de les especies n'otres dómines y son una referencia de la so evolución,[236] y son independientes de los arbitrios d'un investigador o "pequenu lab"[cita 65] que quiciabes se desfacer de les colecciones dempués de la muerte del especialista, o quiciabes él mesmu tenga de desfacer dacuando de les colecciones que nun utiliza pa faer llugar nel espaciu llindáu que-y ye asignáu na universidá pa depositar coleutes nueves. Güei envalórase que s'atopen depositaes ente 1,2 y 2,1[240] o 3 mil millones[241] d'unidaes. Les colecciones dedicaes tienen de tar preparaes pa la crecedera constante de les sos colecciones[24] de lo que s'ocupen en parte los sos curadores por aciu los intercambios con otres colecciones, quien tamién faen el pervalible trabayu de re-identificación d'especies pa garantizar la so actualidá y evitar espardimientos d'erros[238][230]; y *(2)

L'entrenamientu y salariu de nuevos taxónomos quien, sobre la base de los datos crudos tomaos de les sos coleutes y otres primeramente depositaes en colecciones, publicar trabayos de lliteratura taxonómica primaria (namá preparar, la finalidá del impresionante programa PEET[234], nun funcionar porque depués nun consiguieron trabayu[237]).

Como la mayor parte del trabayu científicu, el trabayu de l'alfa-taxónomo ye conducíu en proyectos relativamente pequenos, con un investigador principal con un llaboratoriu asignáu na universidá y dedicación part-time al proyectu, y quiciabes dos o trés estudiantes de doctoráu que yá se ganaron esa primer beca utilizando'l llaboratoriu d'otru o investigadores part-time del staff.[242] En taxonomía descriptiva los proyectos son particularmente pequeños, de normal faise referencia a un solu investigador, "el taxónomo especializáu en tal taxón", que trabaya en solitariu nun taxón particular col so salariu cobráu na universidá o'l muséu.[230] La mayor parte de los subsidios (grants) otorgaos por axencies gubernamentales o internacionales dedicaes a la mantención de la ciencia son otorgaos a la "pequena ciencia" (small science), con una duración promediu de 3 años,[242] el investigadores caltienen la so estabilidá llaboral consiguiendo empléu nuna universidá -o museos d'hestoria natural, xardinos botánicos-, a los que dediquen la otra parte del so tiempu de trabayu.[242] En ciencia, pocos proyectos son ambiciosos y arreyen docenes de científicos, de normal enfocaos en tomar de datos relativamente homoxéneos y en cantidá xigantesca entamaos alredor de dalguna instrumentación caro y dedicao,[242] la llamada "big science" qu'apurre "big data", de la que los exemplos que suelen mentase son l'astronomía y la física de les partícules d'alta enerxía.[236] Les universidaes perciben un porcentaxe de los subsidios adquiríos polos sos investigadores y del prestíu qu'éstos acarreten polo que tienen preferencia por ocupar investigadores que los llogren.[235] Les axencies de subsidios obliguen a l'alfa-taxonomía a competir con otros proyectos pa ganar los grants, pero ésta termina apostrada por razones n'apariencia emocionales[24][23] -munchos usuarios y hasta científicos ven a l'alfa-taxonomía o taxonomía descriptiva como una "ciencia polvorienta"[243][244], y nun paeciera que los tremaos taxones de los que s'ocupa'l so pisu pudiera afectar el trabayu del restu de la facultá[230].

El investigadores que yá tienen el so propiu llaboratoriu son los qu'escueyen d'ente los estudiantes de les sos materies a los que van pidir un subsidiu y un puestu de trabayu y que potencialmente van competir col mesmu investigador que-yos ta dando una oportunidá, esto foi mentáu como torga ([235],[245],[230]en rta. a[234]), pero nun hai diferencies nesi puntu ente les demás cañes de la ciencia y l'alfa-taxonomía. ([230],[235],[245]) El mecanismu pa evaluar el trabayu d'un científicu tradicionalmente ye la so visibilidá,[246][244] d'esa forma promociónase la calidá y se desalientan les conductes desaparentes.[246][247] Pero va décades que-y lo evalúa no que se convirtió unu de los puntos más sobresalientes nel so currículum:[230][248] la cantidá de publicaciones en revistes científiques y el prestíu de cada revista na que se publicó midíu en forma de "factor d'impactu", esti postreru calculáu pol Institute of Scientific Information (ISI), dende los '90 parte de Thomson Reuters[nota 17]. El factor d'impactu como anguaño calculáu ye, en cada añu determináu, de les revistes indexadas na Web of Science (WoS) -índiz calteníu por Thomson Reuters-, la cantidá de vegaes que se citaron mientres l'añu los artículos publicaos nesa revista nos 2 años anteriores a esi, estremáu'l númberu total d'artículos publicaos por esa revista nesos dos años[237][250]. Los científicos intenten publicar en revistes d'altu impactu p'alimentar el so currículum, pero éstes suelen refugar los trabayos de índole taxonómica por cuenta de qu'ocupen enforma espaciu na revista y argumenten[251][252][237][253] que la so baxa cantidá de cites nos 2 años siguientes menguará-yos el factor d'impactu. Les publicaciones taxonómiques son llargues, riquen munches ilustraciones, y típicamente tienen una audiencia bien especializada que dura per munchos años: la vida promediu d'una monografía taxonómica puede calculase en décades o hasta centuries, en llugar d'en meses o n'años como'l común de les publicaciones.[254][237] Al autor de la mesma tóma-y años o inclusive décades la realización d'una monografía;[248] los sos trabayos más acabaos publicar a la fin de la so vida.[23] Parte fundamental anque implícita de la estructura d'un trabayu científicu, artículos bien diversos utilicen per munchos años la información o les claves recoyíes de cada publicación d'alfa-taxonomía, pero nun hai costume de citalos nes referencies (delles revistes riquen que al nomar un taxón cítese l'autor del nome y la primer descripción, pero tampoco riquen que los cite nes referencies).[253][237][244][248] La información recoyida impresiona como si nun precisara un autor que lu sofite, nun hai interés de les editoriales que cuerren tres les métriques de factor d'impactu en citalos[245], nin una vegada publicaos amiéstase la cita correspondiente nin los ralos temporales afechos nos índices de los que se faen los analises de ránkings, polo qu'el autores de les descripciones y claves queden fora del rangu reconocíu de publicaciones no emocional y nes métriques de factor d'impactu[248]. La necesidá de cumplir con un estragal d'impactu, que nun mide la calidá nin la necesidá de la descripción d'un taxón, sinón la "atención"[255][235] que se-y empresta al mesmu, tamién aumenta la disparidad nes descripciones taxonómiques: provocó la deserción en sub-campos d'investigación pequenos o impopulares[256], polo que los llamaos "taxones subrepresentados", ruinamente descriptos, inda son ignoraos[237][256]; nel otru estremu ta dándose-y una importancia desatamañada, por cuenta de la so popularidá, a los estudios que testean les hipótesis taxonómiques puramente por métodos moleculares y a les publicaciones sobre los bien espublizaos ADN barcodes, magar ésta ye namá una de les ferramientes utilizaes polos taxónomos pa testear les llendes de los taxones y p'identificalos[237]. El númberu de cites amenorgar a les que faen los pocos taxónomos especializaos nel mesmu taxón nos dos años siguientes a les esporádiques publicaciones, y de la mesma si estos colegues publiquen nes poques revistes taxonómiques cubiertes pol índiz de Thomson Reuters.[254] Los trabayos publicaos pal legu o non intencionales pa ser citaos, como les empones de campu, nun son valoraos.[23] Les monografíes, flores y faunes paecen un trabayu que se fai con un salariu que se va pagar sía comoquier, nun se premien con subsidios los trabayos terminaos.[23] El taxónomo nun percibe la conveniencia de publicar tol material que tien,[234][256][23][257] y una fonte de conocencia pervalible perder col retiru del especialista, volviéndose tras nes hipótesis taxonómiques sobre'l so taxón.[234][258] L'alfa-taxonomía claramente precisa que se amolde a la so midida la manera d'evaluar les sos publicaciones científiques, nesta "yera del factor d'impactu" (HCJ Godfray[110], S Knapp[110], I Agnarsson[237], M Kuntner[237], YL Werner[256], R Page[259], MC Ebach[233][260], AG Valdecasas[261][262][233][260], QD Wheeler[233][260], LR Landrum[23], S Castoviejo[261], LF Marcus[261], MR de Carvalho[260], DM Williams[260], SS Nihei[260], MT Rodrigues[260], T Grant[260], LF Silveira[260], H Zaher[260], AC Gill[260], RC Schelly[260], JS Spaks[260], FA Bockmann[260], B Séret[260], H-C Ho[260], L Grande[260], O Rieppel[260], A Dubois[260], A Ohler[260], J Faivovich[260], LCS Assis[260], PZ Goldstein[260], EAB de Almeida[260], G Nelson[260], JL Payne[248], FA Smith[248], M Kowalewski[248], RA Krause Jr[248], AG Boyer[248], CR McClain[248][244], S Finnegan[248], PM Novack-Gottshall[248], L Sheble[248], CHC Lyal, AL Weitzman[205], T Borsch, P Hernández-Ledesma, WG Berendsohn, H Flores-Olvera, H Ochoterena, FO Zuloaga, S von Mering y N Kilian 2015 manuscritu aceptáu[263], JV Crisci[264], F Boero[249], H Wägele[265], A Klussmann-Kolb[265], M Kuhlmann[265], G Haszprunar[265], D Lindberg[265], A Koch[265] y JW Wägele[265], KA Seifert[266], PW Crous[266], JC Frisvad[266], P Pyšek[252], PE Hulme[252], LA Meyerson[252], GF Smith[252], JS Boatwright[252], NR Crouch[252], Y Figueiredo[252], LC Foxcroft[252], V Jarošík[252], DM Richardson[252], J Suda[252], JRU Wilson[252], van der Velde[267], F-T Krell[268], J Ellis[269], HAI Benítez[270], LA McDade[271], DR Maddison[271], R Guralnick[271],HAI Piwowar[271], ML Jameson[271], KM Helgen[271], PS Herendeen[271], A Hill[271], ML Vis[271], GH Pyke[272], B Páll-Gergely[273], P Venu[274], M Sanjappa[274], a pesar de la respuesta del ceador del IF, Y Garfield[275]). PA Lawrence recordábanos nel 2008[245] que la forma más segura d'evaluar un trabayu científicu ye lleéndolo -la forma habitual de faelo nel pasáu. El problema d'esti enfoque ye que namá evalúa en retrospectiva, sobre trabayos que tomaron munchos años de realización.[23]

Delles conductes escontra la nomenclatura formal pueden amenorgar la calidá de la información taxonómica y repercutir nel prestíu de la caña polo xeneral[237][102]. Nun hai requisitos mínimos pa describir una especie, y dellos autores tán d'alcuerdu en nomar una coleuta de la que nun pudo determinase'l taxón al que pertenecía depués de la revisión taxonómica siempres que tea correchamente depositada nuna colección accesible por otros taxónomos, como si afitárase un epítetu a un "tipu" pa dempués circunscribir les especies cuando pueda presupuestase[276], pero hai autores que denuncien que delles coleutes tán siendo nomaes formalmente ensin qu'el paper brinde la posibilidá a los demás biólogos de retomar o testear les sos hipótesis, o ensin faer una revisión taxonómica refecha que lo xustificara.[102][237][277][278] Decenes de miles de nomes nuevos publicar por añu[153], de los cualos un porcentaxe bien alto, que según l'autor y el taxón trataos pue ser envaloráu ente'l 25 y el 75%,[279][280] van ser nomes sinónimos de nomes previos d'especies más llargamente distribuyíes o más variables que lo originalmente descripto. En plantes angiospermas, quiciabes el grupu más estudiáu, calcúlase qu'hai 5 vegaes más nomes científicos qu'especies según los conceutos taxonómicos actuales.[281] Nun paez que se valoren los data papers, les publicaciones qu'esponen los datos de les coleutes ensin cambeos nes hipótesis taxonómiques -qu'a pesar del nome, inclúin munches hipótesis taxonómiques: los calteres, les apomorfías, les especies según cada autor...[24]-, sicasí los papers que contienen actos nomenclaturales como l'establecimientu de nomes nuevos paecieren asumise como una señal honesta de la cantidá de trabayu qu'el autores tomaríense.[282]. Los nomes nun tienen que tar solamente establecíos, tienen que ser nomes "robustos"[230][24].